|
Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~niko/blastp.html
Дата изменения: Wed Jun 2 13:16:37 2004 Дата индексирования: Mon Oct 1 22:04:02 2012 Кодировка: Windows-1251 |
| Длина фрагмента | Порядковый номер хита | % совпадающих остатков | Вес выравнивания | E-value |
| 30 | 1 | 100% | 63.5 | 1e-10 |
| 10 | 1 | 100% | 23.5 | 95 |
Как видно, в первой двадцатке представлены как ортологи(белки разных организмов с одинаковыми функциями; выделены жирным), так и паралоги(белки с разными функциями, имеющие общее происхождение) и прочая ерунда. Т.е ортологи через BLASTP искать нельзя.
| Sequences producing significant alignments: | Score (bits) | E-value |
|---|---|---|
| P36944 RBSR_BACSU Ribose operon repressor | 605 | 3e-66 |
| Q9K6K2 RBSR_BACHD Ribose operon repressor | 250 | 7e-63 |
| Q9CF41 RBSR_LACLA Ribose operon repressor | 239 | 2e-35 |
| P43472 SCRR_PEDPE Sucrose operon repressor ... | 148 | 9e-35 |
| Q45831 REGA_CLOSA HTH-type transcriptional ... | 145 | 3e-34 |
| P25144 CCPA_BACSU Catabolite control protein ... | 144 | 5e-34 |
| Q9CPA2 RBSR_PASMU Ribose operon repressor | 143 | 2e-31 |
| P58258 REGA_CLOAB HTH-type transcriptional ... | 134 | 3e-31 |
| Q54430 SCRR_STRMU Sucrose operon repressor ... | 134 | 8e-31 |
| P06964 CYTR_ECOLI HTH-type transcriptional ... | 132 | 3e-30 |
| Q56194 CCPA_STAXY Probable catabolite control... | 130 | 3e-30 |
| P46828 CCPA_BACME Glucose-resistance amylase ... | 130 | 5e-30 |
| P44329 RBSR_HAEIN Ribose operon repressor | 130 | 5e-30 |
| P37947 DEGA_BACSU HTH-type transcriptional ... | 130 | 5e-30 |
| Q8CNV8 CCPA_STAEP Probable catabolite control... | 127 | 4e-29 |
| P25551 RBSR_ECOLI Ribose operon repressor | 125 | 1e-28 |
| O68446 PURR_SALTY HTH-type transcriptional ... | 124 | 2e-28 |
| P15039 PURR_ECOLI HTH-type transcriptional ... | 124 | 4e-28 |
| P27871 ENDR_PAEPO Probable HTH-type transcrip... | 121 | 3e-27 |
| Q8NW33 CCPA_STAAW Probable catabolite control... | 120 | 3e-27 |