|
Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~nihilenia/term2/pfam.html
Дата изменения: Wed Sep 13 02:49:14 2006 Дата индексирования: Tue Oct 2 08:45:08 2012 Кодировка: Windows-1251 |
| Фосфоенолпируват карбоксилаза (ec 4.1.1.31) (pepcase) (pepc). Схематическое и 3D-изображение доменной структуры. | |
|
|
|
| Идентификатор Pfam | Название записи | Полное название домена | Положение в последовательности CAPP_ECOLI |
| PF00311 | PEPcase | Фосфоенолпируват карбоксилаза | Цепь А, 1-883 |
Фосфоенолпируваткарбоксилаза (PEPCase), фермент, найденный во всех многоклеточных растениях, катализирует образование оксалоацетата из фосфоенолпирувата (PEP) и иона гидрокарбоната. Эта реакция используется C4 растениями (растения C3 и C4 немного отличны по механизму фотосинтеза) для улавливания и накопления углекислого газа в фотосинтетических группах поверхностных клеток.
Он также играет ключевую роль в пути фиксации азота в корневых клубеньках бобовых; здесь он функционирует совместно с глутамин-, глутамат-, и аспарагин-синтетазами и аспартат-аминотрансферазой для синтеза аспартата и аспарагина, главных веществ, участвующих в переносе азота в различных амин-транспортирующих видах растений.
PEPCase также играет антиплеуротическую роль в бактериях и клетках растений, поставляя оксалоасетат в цикл трикарбоновых кислот (цикл Кребса, TCA), которые требует постоянного добавления С4 молекул (содержащих 4 атома углерода в цепи) для пополнения количества интермедиатов, удаляемых из цикла для биосинтеза аминокислот. С-конец фермента содержит активный сайт, включающий консервативный остаток лизина, вовлеченный в связывание с субстратом, и другие консервативные остатки, необходимые для осуществления каталитического механизма.
На данный этап известно 711 белков, содержащих домен PF00311, или его фрагменты.
Белки с доменом PF00311 встречаются в следуующих таксонах:
|
Таксон |
Кол-во белков с доменом PF00311 | |
| Эукариоты | Растения | 500 |
| Грибы | 1 | |
| Животные | 7 | |
| Бактерии | 194 | |
| Археи | 1 | |
Рассмотрев основные типы архитектуры домена PF00311, приходим к выводу, что
чаще всего встречаются белки с единственным исследуемым доменом, другие типы доменов в принципе в белках отсутствуют, из чего можно сделать
вывод, что белки семейства PEPCase достаточно специфичны по своим функциям. Наряду с абсолютным
большинством "однодоменных" структур существует четыре белка с продублированным доменом PF00311. Это
такие белки, как Q5ZV35_LEGPH, Q5X4V1_LEGPA,
Q5WWN4_LEGPL, Q9EYP4_BURPS.