Доменная структура белка BioA_ECOLI

Зеленым отмечено положение домена Aminotran_3 из PfamA и разноцветным "необработанные" домены из PfamB.

Пространственная структура белка BioA_ECOLI

Домен Aminotran_3 отменчен зеленым (общий вид). Серым обозначена остальная часть белка BioA_ECOLI, в ней находятся домены из PfamB.

Домен Aminotran_3: общий вид, вид снизу, вид сбоку.

Идентификатор Pfam	Название записи	Полное название домена	Положение в последовательности BioA_ECOLI
PF00202	Aminotran_3	Аминотрансфераза класса III	с 28й по 372ю аминокислоту

Подробное описание домена PF00202

1. Описание домена Aminotran_3

   Аминотрансферазы участвовать конкретные относящийся к механике характерные черты с другими перидоксилфосфат - зависимые ферменты, таких как ковалентное связывание перидоксилфосфатных групп к лизин остаток. On the basis of sequence similarity, these various enzymes can be grouped PUBMED:1618757 into subfamilies. One of these, called class-III, includes acetylornithine aminotransferase (), which catalyzes the transfer of an amino group from acetylornithine to alpha-ketoglutarate, yielding N-acetyl-glutamic-5-semi-aldehyde and glutamic acid; ornithine aminotransferase (), which catalyzes the transfer of an amino group from ornithine to alpha-ketoglutarate, yielding glutamic-5-semi-aldehyde and glutamic acid; omega-amino acid--pyruvate a minotransferase (), which catalyzes transamination between a variety of omega-amino acids, mono- and diamines, and pyruvate; 4-aminobutyrate aminotransferase () (GABA transaminase), which catalyzes the transfer of an amino group from GABA to alpha-ketoglutarate, yielding succinate semialdehyde and glutamic acid; DAPA aminotransferase (), a bacterial enzyme (bioA), which catalyzes an intermediate step in the biosynthesis of biotin, the transamination of 7-keto-8-aminopelargonic acid to form 7,8-diaminopelargonic acid; 2,2-dialkylglycine decarboxylase (), a Pseudomonas cepacia enzyme (dgdA) that catalyzes the decarboxylating amino transfer of2,2-dialkylglycine and pyruvate to dialkyl ketone, alanine and carbon dioxide; glutamate-1-semialdehyde aminotransferase () (GSA); Bacillus subtilis aminotransferases yhxA and yodT; Haemophilus influenzae aminotransferase HI0949; and Caenorhabditis elegans aminotransferase T01B11.2. Description text from InterPro entry IPR005814

2. Белки с доменом Aminotran_3

   Домен Aminotran_3 присутствует в 1665 белках.

3. Присутствие домена Aminotran_3 в организмах различных таксонов

   Таксон		Количество белков с доменом PF00202
   Эукариоты	Растения	50
   	Грибы	127
   	Животные	80
   Бактерии		1303
   Археи		93

4. Доменная архитектура

   Домен Aminotran_3 - единственный домен в белке, встречается гораздо чаще чем, домен Aminotran_3 в сочетании с другими доменами. Домен Aminotran_3 единственный домен в белке только в 1587 белках, а белков, в которых домен Aminotran_3 не единственный - 71.

   Домен Aminotran_3 в дублированном виде встречается в 34 белках. Например, Q5KMS7_CRYNE (аденозилметионин-8-амино-7-оксононаноат трансаминаза, предполагаемый)

   Случаи перестановки 2-х доменов местами, если один из доменов Aminotran_3, не известны.