Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~nasting/term2/ex1.html
Дата изменения: Sat Mar 4 16:41:07 2006
Дата индексирования: Tue Oct 2 07:02:36 2012
Кодировка: Windows-1251
Белок BioA_ECOLI в банках Swiss-Prot и TrEMBL


На главную второго семестра    На главную

Белок BioA_ECOLI в банках Swiss-Prot и TrEMBL

Документ, содержащий информацию о белке BioA_ECOLI, извлеченный из базы данных SwissProt, находится по этой ссылке.

Ниже расположены результаты упражнений занятия 1.

  Метка поля Содержание
Код доступа ("Accession number") AC P12995
Идентификатор последовательности в БД ID BIOA_ECOLI
Название (краткое описание) белка DE аминотрасфераза 7, 8-диамино-пеларгоновой кислоты (EC 2.6.1.62) (7,8-diamino-pelargonic acid aminotransferase) (DAPA aminotransferase)
Дата создания документа DT 01 января 1990
Дата последнего исправления аннотации DT 07 февраля 2006
Название организма OS Escherichia coli
Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia
Длина последовательности ID 429 а. о.
Молекулярная масса белка SQ 47336 г/моль
Число публикаций, использованных при создании документа RN 4
Название журнала с самой свежей публикацией RL J. Mol. Biol. 291:857-876 (1999)
Описание вторичной структуры FT Описание существует. Оно содержит информацию об альфа-спиралях, тяжах с указанием их положения (номер аминокислоты начала и конца) в последовательности.
Что содержит поле комментариев? CC Поле комментариев содержит описание каталитической активности, каким кофактором является, участие в процессах биосинтеза,подразделение на субединицы, внутриклеточное положение, отношение к тому или иному семейству.
Какие особенности последовательности указаны? FT Существуют разные данные об аминокислоте под номером 11 (R -> P (in Ref. 2)) и о последовательности с 99 по 102 последовательности (TPQP -> SGRNA (in Ref. 1))
Идентификаторы записей PDB DR 1DTY; 1MGV; 1MLY; 1MLZ; 1QJ3; 1QJ5; 1S06; 1S07; 1S08; 1S09; 1S0A

Запрос  Число документов в SwissProt   Число документов в TrEMBL 
DAPA aminotransferase 30 8
aminotransferase 1048 5963
 7,8-diamino-pelargonic acid  20 1


©Dzhanibekova Anastasia