Доменная структура белка TPIS_ECOLI.

База данных PFAM включает 7426 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых доменов, включая их множественные выравнивания. Каждый домен в PFAM описан с помощью профиля-НМM.

Согласно базе данных PFAM в белке TPIS_ECOLI существует 1 домен

Изображение доменной структуры TPIS_Ecoli:

а) краткое название TIM

б) расположение в последовательности: 4 - 250

Участок низкой сложности: 238 - 255

Участки низкой сложности, это участки искаженного соcтава. Эти участки часто мозаичны и состоят из маленького набора аминокислот.Эти участкифункционально важны в некоторых белках, но в целом, их функция не достаточно ясна.

в) идентификатор записи в PFAM: PF00121

г) краткое описание свойств домена TIM - гликолитический фермент, который катализирует взаимные преобразования глицеральдегид-3-фосфата и дигидрооксиацетонфосфата. TIM играет важную роль в некоторых метаболических путях и существеннен для продукции энергии. Это димер из двух идентичных субединиц, каждая из которых сделана из примерно 250 аминокислотных остатков. Остаток глутаминовой кислоты вовлечен в каталитический механизм. Последовательность вокруг активного сайта остатка консервативна в известном TIM. Нехватка TIM ассоциирована с гемолитической анемией в паре с прогрессивным стойким нейрологическим расстройством.

Пространственная модель структуры