Задание 14 (выполнено Борисовой Мариной)

Задача: научиться пользоваться возможностями программы RasMol.

Заданный PDB файл: 1KQF.

I. Получение изображения, иллюстрирующее водородные связи между остовными атомами одного из элементов вторичной структуры.

Правило следующее: водородная связь идет от О атома n-го остатка до N атома n+4 остатка. Каждый остаток образует 2 водородные связи.

II. Создание точечной диагрммы, иллюстрирующую распределение углов ? и ?: а) в выбранном элементе вторичной структуры, б) во всей цепи белка, которой принадлежит этот элемент.

Обе диаграммы показывают, что наиболее типичные торсионные углы для цепи C молекулы оксидоредуктазы E.coli находятся в диапазонах: ?=[-60;-10] и ?=[-40;-100].

Таблица данных.

ї 2010 Borisova Marina