Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~mihasia/t1_files/trua_ecoli.htm
Дата изменения: Wed Dec 22 09:59:49 2004
Дата индексирования: Tue Oct 2 13:10:15 2012
Кодировка: Windows-1251

Page Title На главную

Псевдоуридилат синтетаза I (pseudouridylate synthase I)

Краткое название белка — TRUA_ECOLI
Полное название организма — Escherichia coli , K-12
Название гена — truA
Номер локуса в бактериальной хромосоме — b2318


>TRUA_ECOLI pseudouridylate synthase I
MSDQQQPPVYKIALGIEYDGSKYYGWQRQNEVRSVQEKLEKALSQVANEPITVF
CAGRTDAGVHGTGQVVHFETTALRKDAAWTLGVNANLPGDIAVRWVKTVPDDFH
ARFSATARRYRYIIYNHRLRPAVLSKGVTHFYEPLDAERMHRAAQCLLGENDFT
SFRAVQCQSRTPWRNVMHINVTRHGPYVVVDIKANAFVHHMVRNIVGSLMEVGA
HNQPESWIAELLAAKDRTLAAATAKAEGLYLVAVDYPDRYDLPKPPMGPLFLAD

Вычисления Excel с помощью меня.

Аминокислотный состав белка

Аминокислота
Частота остатка в truA_ECOLI
A (Аланин)
11,5%
C (Цистеин)
1,1%
D (Аспарагиновая кислота)
5,6%
E (Глутаминовая кислота)
4,8%
F (Фенилаланин)
3,3%
G (Глицин)
5,9%
H (Гистидин)
4,1%
I (Изолейцин)
3,7%
K (Лизин)
4,1%
L (Лейцин)
7,4%
M (Метионин)
2,2%
N (Аспарагин)
4,1%
P (Пролин)
5,6%
Q (Глутамин)
4,4%
R (Аргинин)
7,4%
S (Серин)
3,7%
T (Треонин)
5,2%
V (Валин)
9,6%
W (Триптофан)
1,9%
Y (Тирозин)
4,4%

Длина последовательности — 270 а.о.

Молярная масса — 30403,72 г/моль.

Средний заряд молекулы при рН=7.0 — 4,39

Отношение количества гидрофобных к количеству гидрофильных аминокислот: 1,02

Белок TRUA_ECOLI, возможно, является мембранным, т.к. отношение количества гидрофобных к количеству гидрофильных аминокислот больше 1, но в мембранных транспортерах класса TC.2A отношение значительно больше, чем в моем белке. Следовательно, белок, возможно, только частично мембранный.