Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~mihasia/pfam.html
Дата изменения: Tue May 31 16:49:02 2005
Дата индексирования: Mon Oct 1 22:51:05 2012
Кодировка: Windows-1251

Pfam На главную

Описание доменной структуры TRUA_ECOLI в базе данных Pfam

По идентификатору было найдено описание доменной структуры TRUA_ECOLI в базе данных Pfam

Изображение доменной структуры аминокислотной последовательности TRUA_ECOLI

Домен 1

PF01416 — идентификатор Pfam домена
PseudoU_synth_1 — сокращенное название
Полное название — тРНК псевдоуридин синтаза
Положение домена в последовательности — 14-112 а.о.

Домен 2

PF01416 — идентификатор Pfam домена
PseudoU_synth_1 — сокращенное название
Полное название — тРНК псевдоуридин синтаза
Положение домена в последовательности — 151-253 а.о.

Изображение положения доменов в 3D-структуре

Идентификатор PDB — 1dj0

Описание семейства доменов, к которому относится N-концевой домен TRUA_ECOLI

Описание доменов данного типа

тРНК-псевдоуридинсинтаза содержит 1 атом цинка, необходимый для ее нативной конформации и узнавания тРНК и имеет строго консервативный остаток аспарагиновой кислоты, участвующей в процессе катализа. Она участвует в образовании псевдоуридина в позициях 38, 39 и 40 в стебле антикодона и петле тРНК. Псевдоуридин - самый часто модифицируемый нуклеозид, найденный в клеточных РНК.

Описание таксонов, в которых встречаются белки с такими доменами

Таксон		Количество белков с доменом PB009524
Эукариоты	Растения	12
Грибы	22
Животные	20
Бактерии		147
Археи		16

Информация относительно доменной архитектуры:

Известно 268 белка с доменом PB009524
Домен PB009524 может быть как единственным,так и с другими доименами.
Случаев дупликации домена PB009524 — 240