Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~megabotan/term4/text/task8.html
Дата изменения: Mon May 30 15:46:26 2011
Дата индексирования: Tue Oct 2 18:02:33 2012
Кодировка: Windows-1251
EC (классификация ферментов). KEGG (Метаболические пути) head
первый семестр второй семестр главная страница

EC (классификация ферментов). KEGG (Метаболические пути)

1. Объяснение кода моего фермента

  • Код фермента EC 2.4.2.22
  • Расшифровка по пунктам:
    EC 2 - Трансфераза (Transferase)
    EC 2.4 - Гликозилтрансфераза (Glycosyltransferases)
    EC 2.4.2 - Пентозилтрансфераза (Pentosyltransferases)
    EC 2.4.2.22 - ксантин фосфорибозилтрансфераза (xanthine phosphoribosyltransferase)
  • Уравнение реакции - XMP + diphosphate = 5-phospho-α-D-ribose 1-diphosphate + xanthine
  • Графическое изображение:

    • 2. Определение в каких метаболических путях участвует изучаемый фермент.

    bsu00230 Purine metabolism - пуриновый метаболизм
    bsu01100 Metabolic pathways - метаболические пути
    bsu01110 Biosynthesis of secondary metabolites - биосинтез вторичных метаболитов
    Пуриновый метаболизм:

    3. Определение структурной формулы L-аспартата и L-лизина

    L-Aspartate - C00049 -
    L-Lysine - C00047 -

    4. Метаболический путь от L-аспартата к L-лизину

    Выбранная цепочка ферментативных реакций: путь: биосинтез лизина цепочка: L-аспартат -> L-4-аспартил фосфат -> L-аспартат-4-семиальдегид -> L-2,3-дигидродипиколинат -> L-2,3,4,5-тетрагидродипиколинат -> L-2-амино-6-оксопимелат -> мезо-2,6-Диаминопимелат -> L-лизин

    Как видно, направление есть, и оно ведет от L-аспартата к L-лизину, поскольку стрелка мезо-2,6-Диаминопимелат -> L-лизин направлена лишь в одну сторону.

    5. Сравнение метаболических путей у разных организмов

    Возможность выбранной цепочки ферментативных в разных организмах с известными полными геномами.

    Организм Возможна ли цепочка реакций
    (да/нет/неизвестно)    		 Обоснование
    Escherichia coli K-12 MG1655 да присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций
    Archaeoglobus fulgidus да присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций
    Arabidopsis thaliana да присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций
    Homo sapiens да присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций
    Карта метаболического пути Escherichia coli K-12 MG1655

    Сравнение ферментов из далеких организмов

    Правильный CSS! Valid HTML 4.01 Transitional

    © Almukhametov Azat