Четвертый семестр

• Блок 1.Распознавание генов

  • Поиск прокариотических и эукариотических генов.
  
  

• Блок 2.

  Функции генов и их продуктов

  • Функции. Онтологии.
    
  • Общее знакомство со структурой GO.
    
  • Описание функций пептиддеформилазы с помощью ресурсов EcoCyc.
    

  Классификация функций. Ферменты

  • Значение пунктов кода фермента EC 1.1.1.22
    
  • Исследование средств специализированного ресурса Brenda
    
  • Сравнение ферментов с одинаковым кодом из эволюционно далеких организмов
    
  • Характеристика фермента по данным ресурса ENZYME
    

  Метаболические пути. KEGG

  • Описание ферментативной реакции
    
  • Поиск заданного метаболического пути. Сравнение ферментов разного типа, катализирущих одну и ту же реакцию.
    
  • Cравнение метаболических путей у разных организмов.
    

  Мембранные белки

• Предсказание топологии белка
  

  Анализ филогенетического дерева

• Исследование филогенетического дерева белков семейства глобинов.
  
  

• Блок 3.

  • Анализ множественного выравнивания последовательностей белков, гомологичных DEF_ECOLI
    
  
  Приложение:
  PF01327_last.msf
  PF01327_svetka.msf
  align.fasta
  PF01327.hmm
  sw_results.hmm
  
  

• Блок 4.

  • База данных SDAP
    
    
    
    
    
    
    
    
    
    
    
    
    
    
    
    ї Андреева Мария aka mashik 2006