Четвертый семестр

Блок 1
1-2. Что такое филогенетическое дерево
3. Алгоритмы реконструкции деревьев
4. Реконструкция филогении по нуклеотидным последовательнсотям. Анализ деревьев, содержащих паралоги.

Блок 2
1. Эволюционные домены. Pfam.
2. Функции. Онтологии базы данных GO.
3. EC (классификация ферментов). KEGG (Метаболические пути)
4. Трансмембранные белки

Блок 3
1. Создание паттерна по выравниванию семейства белков
2. Простейший профиль: частотная матрица
3. Пакет Pftools

---

© Dzama Margarita, 2011