Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~margo77/term1/secondary.html
Дата изменения: Wed Dec 23 02:49:22 2009
Дата индексирования: Tue Oct 2 11:54:02 2012
Кодировка: Windows-1251
Исследование вторичной структуры белка

Общее описание вторичной структуры белка NADE_BACSU


В одной цепи содержится 13 спиралей, 7 β - тяжей и 23 реверсивных поворотов


Судя по изображению данный белок относится к альфа-структурным белкам

Множество атомов остова элементов вторичной структуры

Для исследования выбраны элементы вторичной структуры:

α-спираль 128-150
β-тяжи 41-44, 72-78, 101-104
реверсивный поворот- 79-85

2. Cвойства α-спирали



Паттерн Н-связей:

H(128,132), H(129,133), H(130,134), H(131,135), H(132,136), H(133,137) и т.д.
или
H(k,k+4), где k={128..146}

Используемый скрипт

3. Cвойства β-тяжа


Используемый скрипт

4. Cвойства реверсивного поворота

Аминокислотные остатки образующие поворот:

His81,Gly82,Thr83,Gln84.

Водородные связи H(85,83) и H(84,82) и H(82,80) скрепляют поворот


Используемый скрипт


© Dzama Margarita,2009-2010