Cемейства доменов

Описание доменной организации белка, с использованием ресурсов Pfam.

Доменная организация белка Muth_Ecoli

Схематическое изображение доменной структуры Muth_Ecoli по данным БД Pfam	Домены, отмеченные на пространственной структуре Muth_Ecoli по данным записей PDB (1azo)

Домены в последовательности Muth_Ecoli

Описание N-концевого домена белка Muth_Ecoli

• Краткая характеристика домена PF02976.

  MutS, MutL and MutH это три важных белка, необходимых для инициации репарации в метилированной ДНК для исправления ошибок, сделанных во время репликации ДНК в Escherichia coli. MutH отрезает новосинтезированную неметилированную дочернюю цепочку с 5'-конца от последовательности d(GATC) в полуметилированном дуплексе. Для активации MutH необходимо, чтобы MutS и MutL распознали эти ошибки.

Организмы, в которых найдены белки с доменами PF02976

Tаксон		Количество белков с доменом PF02976
Эукариоты	Растения	0
	Грибы	0
	Животные	0
Бактерии		85 белков в 83 организмах
Археи		1

Краткие характеристики:
• Чаще всего домен PF02976 - единственный домен в белке:

  

  Однако не всегда. Например,

  1) В 15 белках встречается следующая доменная организация: Pfam-B_9196 - Muth -Pfam-B_9197:

  

  2) В 2 белках (Q6SFK8_9BACT и Q6F1F9_MESFL): MutH - Pfam-B_26302:

  

  3)В 5 белках (T2S3_STAAU, O87348_9LACT, Q8G6S5_BIFLO, Q724A0_LISMF, Q7BN85_LACLA): MutH - Pfam-B_26302 - Pfam-B_33556:

  

• Cлучаи дупликации домена PF02976 и перестановки двух доменов местами, если один из них PF02976, не известны.

Мотивы в аминокислотной последовательности Muth_Ecoli по данным InterPro



Мотивы в белке Muth_Ecoli по данным InterPro

Название подписи	Положение в последовательности Muth_Ecoli	Полное название базы данных	* Название организации, поддерживающей данных.	* Город и страна
MutH	58-157	Pfam TIGRFAMs	Wellcome Trust Sanger Institute THE INSTITUTE FOR GENOMIC RESEARCH	Кембридж, Англия -
mutH_TIGR	10-226	Pfam TIGRFAMs	Wellcome Trust Sanger Institute THE INSTITUTE FOR GENOMIC RESEARCH	Кембрижд, Англия -
Restrict_endonuc_II-like_core	4-229	SuperFamily	Stanford University University of Texas at Austin University of Bristol	США США Англия

<<Обратно на главную страницу

<<Обратно на второй семестр