Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~lu.andreeva/torsion.html
Дата изменения: Thu Dec 25 13:21:22 2008 Дата индексирования: Tue Oct 2 03:27:14 2012 Кодировка: Windows-1251 |
Торсионные углы - это углы поворота вокруг связей в остове белка: угол фи - угол поворота вокруг связи между N и C(A)-атомами, угол пси - между C(A) и C(O)-атомами.
Значение этих углов определяет положение белка в пространстве. Точечные диаграммы распределения углов фи и пси называют Картами Рамачандрана.
Они показывают наиболее энергетически выгодное состояние белка, оптимальное значение этих двугранных углов.
Рассмотрим такую точечную диаграмму бета-структуры белка 1M33:
![]() Как видно на диаграмме, областью наиболее часто встречаемых значений торсионных углов фи и пси в бета-структуре является: по фи - от (-160) до (-70), по пси - от 90 до 180 градусов, т.е. можно сказать, что для бетта-листа характерно отрицательное значение углов фи и положительное - углов пси.
Рассмотрим структуру белка BIOH_Ecoli:
![]() Судя по этому рисунку, белок состоит из чередующихся альфа-спиралей и бета-складок.
Рассмотрим теперь точечную диаграмму всей структуры белка 1M33:
![]() Так как, как раньше уже говорилось, белок состоит почти что в равной степени из альфа-спиралей и бета-складок, на диаграмме выделяются две области наиболее часто встречающихся значений: область, соответствующая бета-структуре (см. выше), и область от (-135) до (-40) градусов по фи и от (-60) до (60) градусов по пси, соответствующая, вероятоно, альфа-спирали. |