Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~kut/term4/q5rli9_pasdo.needle Дата изменения: Sat Apr 7 02:07:44 2007 Дата индексирования: Tue Oct 2 12:15:40 2012 Кодировка:

########################################
# Program: needle
# Rundate: Sat Apr 07 2007 03:09:46
# Commandline: needle
# [-asequence] Q5RLI9_PASDO.fasta
# [-bsequence] AQP1_HUMAN.fasta
# Align_format: srspair
# Report_file: q5rli9_pasdo.needle
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: Q5RLI9_PASDO
# 2: AQP1_HUMAN
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 271
# Identity: 226/271 (83.4%)
# Similarity: 250/271 (92.3%)
# Gaps: 2/271 ( 0.7%)
# Score: 1169.5
#
#
#=======================================

Q5RLI9_PASDO 1 MAIEFRKKIFWRAVVAEFLAMSLFIFISIGSALGFNFPVVANKTSTRSQD 50
||.||:||:|||||||||||.:||:||||||||||.:||..|:|:. ||
AQP1_HUMAN 1 MASEFKKKLFWRAVVAEFLATTLFVFISIGSALGFKYPVGNNQTAV--QD 48

Q5RLI9_PASDO 51 NVKVSLAFGLSIATMAQSVGHISGAHLNPAVTLGLLLSCQISIFKALMYI 100
||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||:|||||
AQP1_HUMAN 49 NVKVSLAFGLSIATLAQSVGHISGAHLNPAVTLGLLLSCQISIFRALMYI 98

Q5RLI9_PASDO 101 LAQCLGAVVATAILSGVTSSLPGNSLGLNALSEGINAGQGLGIEIIATFQ 150
:|||:||:||||||||:||||.|||||.|.|::|:|:|||||||||.|.|
AQP1_HUMAN 99 IAQCVGAIVATAILSGITSSLTGNSLGRNDLADGVNSGQGLGIEIIGTLQ 148

Q5RLI9_PASDO 151 LVLCVLATTDRRRNDVSGSAPLAIGLSVALGHLLAIDYTGCGINPARSFG 200
|||||||||||||.|:.|||||||||||||||||||||||||||||||||
AQP1_HUMAN 149 LVLCVLATTDRRRRDLGGSAPLAIGLSVALGHLLAIDYTGCGINPARSFG 198

Q5RLI9_PASDO 201 SALIANNFENHWIFWVGPIIGGASAALIYDFILAPRTSDLTDRMKVWTSG 250
||:|.:||.|||||||||.||||.|.||||||||||:||||||:||||||
AQP1_HUMAN 199 SAVITHNFSNHWIFWVGPFIGGALAVLIYDFILAPRSSDLTDRVKVWTSG 248

Q5RLI9_PASDO 251 QVEEYDLEGDDMNSRVEMKPK 271
|||||||:.||:|||||||||
AQP1_HUMAN 249 QVEEYDLDADDINSRVEMKPK 269


#---------------------------------------
#---------------------------------------