Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~kropa8848/term3/practice3/practice3.html
Дата изменения: Thu Dec 23 18:42:36 2010
Дата индексирования: Fri Feb 11 09:06:50 2011
Кодировка: Windows-1251
Комплексы ДНК-белок На главную страницу

ДНК-белковые комплексы

  1. Скрипт
  2. Контакты разного типа в комплексе 1LQ1.pdb

Контакты атомов белка с Полярные Неполярные Всего
      остатками 2'-дезоксирибозы 15 10 25
      остатками фосфорной кислоты 36 16 52
      остатками азотистых оснований со ст 6 5 11
      остатками азотистых оснований со ст 4 4 8


Участок структуры Позиции в структуре
(по результатам find_pair) 		Результаты предсказания
с помощью einverted		 Результаты предсказания
по алгоритму Зукера
Акцепторный стебель B:.601_:[..G]G-----C[..C]:.672_:B
B:.602_:[..G]G-----C[..C]:.671_:B
Всего 7 пар 		предсказано 0 пар 7 пар
D-стебель B:.610_:[..G]G-*---U[..U]:.625_:B
B:.611_:[..U]U-----A[..A]:.624_:B
Всего 4 пары 		предсказано 0 пар 4 пары
T-стебель B:.649_:[..G]G-*---P[PSU]:.665_:B
B:.650_:[..C]C-----G[..G]:.664_:B
Всего 5 пар 		предсказано 0 пар 5 пар
Антикодоновый стебель B:.638_:[..C]C-*---C[..C]:.632_:B
B:.639_:[..G]G-----C[..C]:.631_:B
Всего 7 пар 		предсказано 0 пар 7 пар
Общее число канонических пар нуклеотидов 19 -- 15

©Джумашев