Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~kropa8848/term2/practice2/SRS.html
Дата изменения: Fri Apr 30 16:43:49 2010
Дата индексирования: Tue Oct 2 18:50:50 2012
Кодировка: Windows-1251
Занятие 2 Шаблон первокурсника Джумашева на главную страницу

Поисковые системы

1.Все три поисковые системы содержат в целом одинаковую информацию, но наиболее удобно рассматривать в том виде, который предложен в системе SRS. Кроме того там довольно наглядно показана вторичная структура белка, лиганды, и т.п.

2. Taxonomy
? Pfam AC Pfam ID Полное название семейства доменов Положение в последовательности белка OXDC_BACSU Клан
gammacoronavirus 70
gammaherpesvirinae 284
gammalipothrixvirus 40
gammapapillomavirus 30
gammaproteobacteria 120605
gammaretrovirus 126
gammaridea 1

Гаммапротеобактерии - gammaproteobacteria(англ.яз.), кол-во страниц 120605

3.Сравнение функций

Запросы


Формулировка функции белка Строка запроса Количество найденных документов
convert ([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & ([swissprot-Comment:convert*] > parent )) 2020
catalyze oxidation ([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & ((([swissprot-Comment:catalyze*] & [swissprot-Comment:oxidation*]) | [swissprot-Comment:catalyze oxidation*]) > parent )) 1521
К сожалению большинство запросов таких как convert oxalate, convert to produce, catalyze oxalate oxidation и др. оказались безрезультатными

4.Сохранение найденного материала в формате fasta.

файл с результатом запроса catalyze oxidention

5.(дополнение задание)

Строка запроса: ([medline-AllText:OXDC*] & [medline-Year#2008:2010])
Количество страниц: 10

6.(дополнительное задание)

Среди опубликованных в 70е годы статей было найдено 27 статей, в которых принимал участие Нейфах А.А.
Запрос: ([medline-Authors:Ne*fa*,A.A.*] & [medline-Year#1970:!1980])
Результат опроса давал три различных варианта написания фамилии Neyfakh,NeÎfakh,Neifakh. Но после просмотра было понятно, что это один и тот же человек. Главный интерес (в 70е годы): исследования по сравнению наследования генетической информации, процессов синтеза белка и митоза в гибридных организмах разных рыб.

©Джумашев