на главную страницу

Структура РНК

1. 2tra.pdb-PDB-код, полученный мной.
2. взята из YEAST (SACCHAROMYCES $CEREVISIAE)
3. TRANSFER RIBO-NUCLEIC ACID (YEAST,ASP) $T/RNA (*A FORM), а индефикаторов цепи не написано.

SEQRES   1     75    U   C   C   G   U   G   A   U   A   G   U   U PSU  2TRA 116
SEQRES   2     75    A   A H2U   G   G H2U   C   A   G   A   A   U   G  2TRA 117
SEQRES   3     75    G   G   C   G   C PSU   U   G   U   C 1MG   C   G  2TRA 118
SEQRES   4     75    U   G   C   C   A   G   A   U 5MC   G   G   G   G  2TRA 119
SEQRES   5     75  5MU PSU   C   A   A   U   U   C   C   C   C   G   U  2TRA 120
SEQRES   6     75    C   G   C   G   G   A   G   C   C   A              2TRA 121

тРНК в остовной модели

Скрипт, которым было получено изображение: restrict rna wireframe off backbone 80 define helix1 1-7, 66-72 select helix1 color white define helix2 49-53, 61-965 select helix2 color red define helix3 38-44, 26-32 select helix3 color blue define helix4 10-13, 22-25 select helix4 color green select U1.P label U1 select C74.P label C74 color label white

1. Водородные связи (не по Уотсону-Крику)
   • A44.N7 и C43.N3
   • G50.O6 и 5MC.N4
     и др.
2. Cтекинг-взаимодействия
   • A14.N1 и G22.N9
     и др.

Использование программы einverted

2tra: Score 15: 5/5 (100%) matches, 0 gaps
      48 cgggg 52      
         |||||
      64 gcccc 60

Работа с mfold