Определение паралогов и ортологов в семействе глобинов.

На главную>Третий семестр> Определение паралогов и ортологов в семействе глобинов

1. Анализ филогенетического древа глобинов.

Рассмотрев данное дерево, я выделил три группы ортологов, кроме выделеной заранее группы миоглобинов; ортологи заключены в окрашенные окрожности. Также были обнаружены паралоги - они выделены прямоугольниками. В ходе рассмотрения было выявлено, что глобин Danio, помещенный в коричневый прямоугольник, может являться и паралогом, и ортологом одной из двух групп, но я склоняюсь к тому, что данный белок все же является паралогом. Также возникла небольшая проблема с двумя белками курицы в группе, окрашенной в голубой цвет, любой из этих двух глобинов может быть паралогом. Примерно та же самая ситуация обстоит и с африканской лягушкой, так как любой из двух белков может быть паралогом, а другой ортологом.

Сравнение филогенетического дерева ортологичных глутаминсинтетаз и таксономии организмов

На данном дереве предсталены организмы из двух крупных таксонов: Bacteria (зеленое выделение) и Archaea (красное выделение). Бактерии представлены тремя групами: Gammaproteobacteria Pasteurella Escherichia Firmicutes Bacillus B Lactococcus Clostrium Thermotogae Thermotoga Глядя на дерево, можно заметить, что археии не обладают таким же упорядоченным расположением в дереве, как бактерии, что скорее всего объясняется их размытой классификацией.