Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~jonik/pfam.htm
Дата изменения: Tue May 25 14:06:44 2004
Дата индексирования: Mon Oct 1 21:34:48 2012
Кодировка: Windows-1251
Доменная структура белка TolC

Доменная структура белка TolC


База данных PFAM включает 7426 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых доменов, включая их множественные выравнивания. Каждый домен в PFAM описан с помощью профиля-НММ.




Согласно базе данных PFAM в белке TolC существует 4 домена.

Название домена Начальный остаток Конечный остаток Идентификатор записи Описание
OEP 27 и 233 211 и 429 PF02321 Белки этого семейства формируют трехмерные каналы: бета-тяжи во внешней мембране и альфа-спирали в периплазме. Эти каналы позволяют транспортировать субстраты в грамотрицательных бактериях.
Сигнальный пептид 1 24   Эта структура необходима для распознования белка,
который будет выделяться из клетки.
Pfam-B 22914 453 495 PB022914 Это участок из искусственно сгенерированной базы данных Pfam-B.



В моем белке повторяются одинаковые домены OEP. Это очень интересно.

На первую страницу

На второй семестр

Назад