Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~jjigor/t2_files/BAliBase.html
Дата изменения: Wed May 25 12:47:26 2005
Дата индексирования: Tue Oct 2 12:08:17 2012
Кодировка: Windows-1251

Сравнение множественного выравнивания, полученного с помощью программы Clustalw, с "биологически правильным" выравниванием из BaliBase На главную страницу второго семестра

Сравнение множественного выравнивания, полученного с помощью программы Clustalw, с "биологически правильным" выравниванием из BaliBase

Блок выравнивания из BaliBase, содержащий нужный фрагмент

идентификатор выравнивания из BaliBase - 1eft_ref1

идентификаторы последовательностей - eftu_theaq, ef1a_sulac, erf2_picpi, selb_ecoli

максимальный процент совпадения последовательностей - 35%минимальный процент совпадения последовательностей - 25%

заданный фрагмент - 151-200

Соответствующий блок, полученный с помощью программы ClustalW

Анализ проводился лишь для аминокислот, прописанных в банке BaliBase заглавными буквами, согласно заданию со 150 по 200 позиции. Как видно, выравнивание, созданное при помощи программы ClustalW не содержит в заданном блоке НИ ОДНОГО верно выравненного столбца. Обьясняется это несовершенством работы программы ClustalW, ее стремлением создать выравнивание с наибольшим весом, что не всегда является биологически осмысленным.