Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~jenechka/term3practice1.html
Дата изменения: Thu Dec 20 16:57:07 2007
Дата индексирования: Tue Oct 2 04:37:27 2012
Кодировка: Windows-1251
Занятие 1 (BLAST)

Занятие 3. Работа в командной строке UNIX

  1. C помощью команды:
  2. infoseq sw:rs3_ecoli > rs3_ecoli.info
    
    была получена информация о записи RS3_ECOLI банка SwissProt файл rs3_ecoli.info

  3. С помощью команды:
  4. infoseq -help 2> infoseq.help 
    
    была получена информация о программе "infoseq" файл infoseq.help

  5. Я создала файлы, содержащие информацию об одной из моих директорий, созданные при помощи различных вариантов команды ls:
  6. ls-t (файл) показывает содержимое директории, отсортированное по времени создания

    minust.txt
    Profile
    PUTTY.RND
    Term3
    winscp.RND
    Term2
    QIP
    vyravnivanie
    antp_drosu.fasta
    antp_drosu.entret
    antp_drome.entret
    antp_drome.fasta
    pax6_human.fasta
    pax6_human.entret
    files
    public_html
    Term1
    typh_ecoli.entret
    pdb2tpt.ent
    typh_ecoli.fasta
    hello
    Tree.Far
    

    ls -u (файл)- то же, без сортировки

    minusu.txt
    minust.txt
    Term3
    QIP
    Term2
    public_html
    Term1
    Profile
    PUTTY.RND
    Tree.Far
    vyravnivanie
    antp_drosu.fasta
    antp_drome.fasta
    antp_drosu.entret
    antp_drome.entret
    pax6_human.fasta
    pax6_human.entret
    files
    winscp.RND
    typh_ecoli.entret
    typh_ecoli.fasta
    pdb2tpt.ent
    hello
    

    ls-x (файл) показывает список файлов в директории записывает в строчку (из колонны делает строки)

    PUTTY.RND	     Profile	        QIP		  Term1
    Term2		     Term3	        Tree.Far antp_drome.entret
    antp_drome.fasta   antp_drosu.entret  antp_drosu.fasta	files
    hello		   minust.txt	      minusu.txt	minusx.txt
    pax6_human.entret  pax6_human.fasta   pdb2tpt.ent	public_html
    typh_ecoli.entret  typh_ecoli.fasta   vyravnivanie	winscp.RND
    

    Команда ls -Q (файл) каждое название файла внутри директории заключает в кавычки

    "PUTTY.RND"
    "Profile"
    "QIP"
    "Term1"
    "Term2"
    "Term3"
    "Tree.Far"
    "antp_drome.entret"
    "antp_drome.fasta"
    "antp_drosu.entret"
    "antp_drosu.fasta"
    "files"
    "hello"
    "minusQ.txt"
    "minusR.txt"
    "minusX.txt"
    "minust.txt"
    "minusu.txt"
    "minusx.txt"
    "pax6_human.entret"
    "pax6_human.fasta"
    "pdb2tpt.ent"
    "public_html"
    "typh_ecoli.entret"
    "typh_ecoli.fasta"
    "vyravnivanie"
    "winscp.RND"
     
    Все файлы находятся по адресу: Н:/home/students/06/jenechka/Term3/Practice1/...
Назад.