Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~igogo/Term2/interpro.html
Дата изменения: Wed May 24 11:03:45 2006
Дата индексирования: Tue Oct 2 08:41:01 2012
Кодировка: Windows-1251

InterPro

Отчет по работе с базой данных InterPro

На главную страницу второго семестра

Описание документа InterPro

На главной странице БД InterPro был проведен поиск документов по АС (р00805) исследуемого белка . Найдено 2 документа. Был выбран документ IPR006034. "Критерий отбора" - наибольшее количество подписей (поле "Signatures") в документе.

Вот данные документа:

Идентификатор документа: IPR006034
Полное название документа: Asparaginase/glutaminase (аспарагиназа/глутаминаза)
Общее количество белков, в которых обнаружен данный домен: 407 белков
Данная подпись находится в отношениях родства с другими подписями; можно привести дерево:

Описание подписей в белке ASPG2_ECOLI, собранных в базе данных InterPro

Найдено полное описание всех известных подписей в аминокислотной последовательности белка ASPG2_ECOLI
(порядок действий: в поле "Matches" выбрано подробное описание с сортировкой по имени белка ("Detailed: sorted by names"). На появившейся странице в меню Select выбрано Protein accession и введен код доступа исследуемого белка. Затем выбрано "detailed"; "View").
Все мотивы в последовательности можно представить графически (по данным InterPro):

Информация о подписях в белке ASPG2_ECOLI.

Название подписи

Положение в последовательности ASPG2_ECOLI

Полное название базы данных

* Название организации, поддерживающей данную БД

* Город и страна

FGGY_KINASES_2 256-277 Prosite (NiceSite View; ExPASy) Swiss Institute of Bioinformatics Geneva, Swiss

asnASE_II 1-348 TIGR-CMR (Comprehensive Microbial Resource) The Institute for Genomic Research Rockville, US

Asp/Glutamnse 40-348 ProDom The ProDom team Toulouse, France

Asparaginase 25-342 Pfam Sanger Institute Cambridge, UK

ASNGLNASE 26-37; 103-121; 282-300 PRINTS-S database (SPRINT) UMBER (University of Manchester Bioinformatics Education and Research) Manchester, UK

ASN_GLN_ASE_1 28-36 Prosite (NiceSite View; ExPASy) Swiss Institute of Bioinformatics Geneva, Swiss

ASN_GLN_ASE_2 104-114 Prosite (NiceSite View; ExPASy) Swiss Institute of Bioinformatics Geneva, Swiss

Asp/Glutamnse 23-348 Superfamily MRC Laboratory of Molecular Biology/ European Bioinformatics Institute/Stanford University Cambridge,UK/Hinxton/USA

їNADEZDA TUKHTUBAEVA,2006

Название подписи	Положение в последовательности ASPG2_ECOLI	Полное название базы данных	* Название организации, поддерживающей данную БД	* Город и страна
FGGY_KINASES_2	256-277	Prosite (NiceSite View; ExPASy)	Swiss Institute of Bioinformatics	Geneva, Swiss
asnASE_II	1-348	TIGR-CMR (Comprehensive Microbial Resource)	The Institute for Genomic Research	Rockville, US
Asp/Glutamnse	40-348	ProDom	The ProDom team	Toulouse, France
Asparaginase	25-342	Pfam	Sanger Institute	Cambridge, UK
ASNGLNASE	26-37; 103-121; 282-300	PRINTS-S database (SPRINT)	UMBER (University of Manchester Bioinformatics Education and Research)	Manchester, UK
ASN_GLN_ASE_1	28-36	Prosite (NiceSite View; ExPASy)	Swiss Institute of Bioinformatics	Geneva, Swiss
ASN_GLN_ASE_2	104-114	Prosite (NiceSite View; ExPASy)	Swiss Institute of Bioinformatics	Geneva, Swiss
Asp/Glutamnse	23-348	Superfamily	MRC Laboratory of Molecular Biology/ European Bioinformatics Institute/Stanford University	Cambridge,UK/Hinxton/USA