Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~homo_sapiens/task9.html
Дата изменения: Fri May 28 10:38:30 2010
Дата индексирования: Tue Oct 2 02:29:13 2012
Кодировка: Windows-1251
Второй семестр. На главную

Задание 9. Множественное выравнивание белка 1wpn_BACSU и его предполагаемых гомологов.

  
    1. В fasta-формате все выравнивание записано, но представить себе его трудно, потому что чтобы сравнить соответствующие
    позиции в разных последовательностях, приходится проматывать список. В формате msf соответствующие позиции стоят в столбик, 
    к тому же еще и раскрашены в зависимости от степени взаимозаменяемости аминокислот, стоящих в этой позиции.


    2. Участки с повышенной долей консервативных позиций: 




     

         

  
Столбцы выравнивания. 
        


        
         		 

          

  
Позиции моего белка.
        


 
        
         		

         
     


     

          

  
4-27
        



        
         		 

          
 

  
0-23    

  

      

 		

         
     
  

 

          

  
310-317
        



        
         		 

          
 

  
70-77   

  

      

 		

         
     
 

 

          

  
330-344
        



        
         		 

          
 

  
90-104   

  

      

 		

         
     
 

 

          

  
377-383
        



        
         		 

          
 

  
137-143    

  

      

 		

         
     
  

 

          

  
385-396
        



        
         		 

          

  
145-156   

  

      

 		

         
     
  

 
 




  Биологического смысла не несет выравнивание в позициях 429-558, так как исходный белок в нем уже не участвует.
Выравнивание в формате msf.
© Червонцева,2009