Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~homo_sapiens/task13.html
Дата изменения: Fri May 28 16:45:30 2010
Дата индексирования: Tue Oct 2 03:33:33 2012
Кодировка: Windows-1251

Task 13 (MeMe), 2010

Задания 1 и 2.

Найдено 3 мотива во всех последовательностях. См. здесь. (мотивы отмечены фигурными скобками в верхней строке)
Мотив 3 частично не выровнен программой muscle. (см. раскраску выравнивания)

Номер мотива	Длина	Относительная энтропия	P-value	Координаты в PPAC_Bacsu
1	50	169,3 бит	2.07e-56	72-121
2	41	130,0 бит	5.2e-46	122-162
3	29	95,5 бит	4.03e-33	2-30

Задание 3.

Результаты поиска мотивов, найденных программой MeMe в последовательностях выравнивания seed из прошлого занятия см. здесь. Всего 95 последовательностей, из них ни одна не содержит все три мотива. 2 и 3 содержат 22 посл-ти, только 3 - 53 посл-ти, толко 2 - 3 посл-ти, только 1 - 4, ни одного - 13.