Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~eremeev/domen.htm
Дата изменения: Fri May 28 15:39:00 2004
Дата индексирования: Mon Oct 1 22:47:33 2012
Кодировка: Windows-1251
Описание свойств индол-3-глицерол фосфат синтетазы, в производных базах данных.
Для описания свойств были использованы следующие базы данных:
Prosite
- первая, в своем роде, база данных, в которой содержатся биологически значимые сайты, паттерны и профили, т.е. те
участки белка, которые могут нести какую-либо биологическую функцию.Документ Prosite может быть представлен либо
в виде паттерна - для сайтов - или профиля PSSM (для мотивов, выводимых из большего числа
последовательностей)
Pfam
- база данных, в которой содержится большая коллекция множественных выравниваний, доменов, семейств и профилей-HMM
для них. Она удобна для анализа доменной структуры белков.
InterPro -
появился в 1999 году, это интегрированый ресурс белковых семейств, доменов и функциональных сайтов. Она содержит
све документы таких баз данных как: Prosite, Pfam, ProDom и всех остальных подобных им.
Определить, какие известные мотивы есть в данной нам последовательности с помощью Prosite
Описать доменную структуру белка по данным взятым из Pfam.
Изучить документы интегрированной базы данных Interpro по даной структуре