Сайт ~ Семестр II ~ Отчет ?1
Работа с системой PubMed
1. Поиск статей, упоминающих конкретный белок.
У белка с кодовым именем "His8_Ecoli" два названия: "histidinol-phosphate aminotransferase" и "imidazole acetol-DE phosphate transaminase". Для поиска по базе данных "PubMed" я использовал первое из них.
Было найдено 36 статей, упоминающих это название. Результаты поиска сохранены в файле query1.txt .
2. Просмотр аннотаций к статьям, поиск публикаций автора.
Для просмотра аннотаций я взял четвертую статью из результатов предыдущего поиска: "Characterization of histidinol phosphate aminotransferase from Escherichia coli". Аннотация к статье сохранена в файле abstract.txt .
От последнего автора этой статьи (Kagamiyama H.) за последние три года в "PubMed" не поступало публикаций. Зато от предпоследнего (Hirotsu K.) их было 9 штук. Результат поиска сохранен в файле query2.txt .
3. Поиск по разговорному названию болезни, отсеивание результатов, вывод с аннотациями.
Поиск шел по слову "shringles" (опоясывающий лишай). Я также ограничил его заголовками статей (shingles[Title]). Было найдено 199 вхождений, из которых большинство оказались вопросами любознательных. Чтобы убрать лишнее, я потребовал (во вкладке "Limits") наличия аннотации. Количество результатов поиска сократилось до 48. Первые двадцать из них (с аннотациями) сохранены в файле query3.txt .
После более тщательного осмотра ("Details") выяснилось, что вместо слова "shingles" можно использовать более научное название ("herpes zoster" по правилам TIAB и MeSH), что PubMed и делает с успехом.
|