Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~dolgov/zachet/1.doc Дата изменения: Wed Nov 30 18:11:00 2005 Дата индексирования: Tue Oct 2 06:15:56 2012 Кодировка: koi8-r

Долгов М., Курс: 1

1. Четкость постановки задачи. -
2. Увязка задачи с проблемной областью. -
3. Адекватность использованных (и планируемых) методов.
a. Поскольку автор работы не указал, белки какого организма он
исследовал, невозможно оценить адекватность полученного
результата.
b. В любом случае непонятно, для чего был проведен поиск ортологов
с последующим построением дерева. Если автор считает эти
процедуры обязательными, это нужно обосновать. Никаких выводов
относительно этого в работе не сделано.
c. Указанная при ссылке на программу построения дерева ссылка не
приводит к таковой. Хотелось бы уточнить, по какому алгоритму
было построено дерево, в частности, является ли оно укорененным.
Если нет, то смысл построения филогенетического дерева по трем
белкам кажется неочевидным.
d. Почему не были использованы программы FindMod, GlycoMod или
FindPept, которые ExPASy рекомендует использовать для дальнейшей
характеризации белка? Учитывая не слишком высокое перекрывание
экспериментальных пептидов с теоретическим белком, хотелось бы
видеть подтверждение предсказания либо с помощью других
компьютерных методов, либо с точки зрения предполагаемой
функции.
4. Вклад студента в решение задачи. Задача идентификации белков не
кажется убедительно решенной.
5. Намечен ли план дальнейших действий. Нет.
6. Текст. Есть некоторые замечания:
a. При первом упоминании программы (любой!) хотелось бы видеть хотя
бы пару фраз о том, что эта программа делает.
b. Рис. 1 и 2 в тексте встречаются по два раза.
c. Ссылки на что-либо отсутствуют начисто.
d. Полностью отсутствую выводы. Нахождение некоторого белка с
помощью некоторой программы есть не вывод, а в лучшем случае
результат.
7. Работа могла бы получить какие-то баллы за общее впечатление, если бы
ее структура соответствовала принятой структуре научных работ.

О.Калинина