Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~dashkache/term6.html
Дата изменения: Wed Dec 26 09:38:40 2012
Дата индексирования: Sun Feb 3 00:19:32 2013
Кодировка: Windows-1251

Четвертый семестр

Шестой семестр

Молекулярное моделирование биополимеров

I. Знакомство с Pymol.

II. Работа Pymol.

III.Cеми-эмпирические вычисления: Mopac.

IV. Abinitio вычисления для нафталина и азулена. Pfam.

V. Вычисление валентных параметров для молекулярной механики.

VI.Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики.

VII. Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS.

VIII. Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS.

IX. Анализ молекулярной динамики биологических молекул в GROMACS.

X.Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом.

XI.Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка.

XII.Пример использования трехмерного QSAR анализа для предсказания активности низкомолекулярных соединений в отношении данного белка.

XIII.Расчет энергии сольватаци димера из двух мономеров полиэтиленгликоля методом FEP.

Главная