Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~dashkache/term1/text/Excel.html
Дата изменения: Mon Nov 9 18:38:31 2009
Дата индексирования: Tue Oct 2 17:54:32 2012
Кодировка: Windows-1251
Особенности аминокислотного состава белка PERR_BACSU

Особенности аминокислотного состава белка PERR_Bacsu



1.Последовательность белка PERR_Bacsu в формате FASTA

>sp /71086/PERR_BACSU
MAAHELKEALETLKETGVRITPQRHAILEYLVNSMAHPTADDIYKALEGKFPNMSVATVYNNLRVFRESGLVKELTYGDASSRFDFVTSDHYHAICENCGKIVDFHYPGLDEVEQLAAHVTGFKVSHHRLEIYGVCQECSKKENH

2. Длина последовательности- 145 а.о.


3. Молекулярная масса белка PERR_Bacsu-16399 а.е.м.

Смотри книгу PeRR_Bacsu.xls,лист MV
Формула: (Сумма по таблице всех масс а.о.)-(атомная масса воды)*(кол-во а.о.-1)

4. Аминокислотный состав белка PERR_BACSU

Аминокислота Частота
Самые частые аминокислоты-E(10%)
Самые редкие аминокислоты-W(отсутствует),Q(2%)
Вычисления проведены с использованием функции СЧЕТЕСЛИ, Смотри книгу PeRR_Bacsu.xls,лист aa_frequencies
A 8%
C 3%
D 5%
E 10%
F 4%
G 6%
H 7%
I 4%
K 6%
L 8%
M 2%
N 4%
P 3%
Q 2%
R 4%
S 6%
T 6%
V 8%
W 0%
Y 5%

5. Средний электрический заряд молекулы

Заряд равен -1e
Вводим данные о заряде аминокислот с помощью функции ЕСЛИ. Заряд аргинина и лизина имеют средний заряд, равный +1е, гистидина - +0.5е, а остальные 0
Функция задается так...=ЕСЛИ(B2="K";1;ЕСЛИ(B2="R";1;ЕСЛИ(B2="E";-1;ЕСЛИ(B2="D";-1;ЕСЛИ(B2="H";0,5;0)))))
Заряд считается 2 способами по таблице :
1) Сумма всех чисел (СУММА(C2:C21))
2) Через функцию СЧЕТЕСЛИ. Найти сколько аминокислот имеют заряд 1;-1;0,5. Каждое число домножить на сооответствующий заряд и сложить
(СЧЕТЕСЛИ(C2:C21;1)-СЧЕТЕСЛИ(C2:C21;-1)+0,5*СЧЕТЕСЛИ(C2:C21;0,5))
Смотри книгу PeRR_Bacsu.xls, лист Charge

6. Сравнение со средним аминокислотным составом белков Bacillus subtilis, а
также с аминокислотным составом мембранных белков этой же бактерии


1-гидрофобные, 2-гидрофильные, 3-можно отнести к обоим классам
Вывод: Белок PERR_Bacsu скорее всего является немембранным, потому что диаграмма мембранного белка отличается от диаграммы заданого белка.
Смотри книгу PeRR_Bascu.xls , лист HPhob_comparison
Первый семестр