Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~crazy.dashko/Term4/8.html
Дата изменения: Mon May 30 15:05:16 2011
Дата индексирования: Tue Oct 2 09:19:03 2012
Кодировка: Windows-1251
Создание паттерна по выравниванию семейства белков.
В моем белке нашелся один паттерн (PDOC00310) - [RKN]-x-[LIVM]-x-G-[ST]-x(2)-[SNQ]-[LIVM]-G-x-{M}-[LIVM]-x(0,1)-[DENG]. Он называется Ribosomal protein L11 signature, или характерная последовательность рибосомального белка L11.
По данному паттерну находятся 3 лишние последовательности и не находятся 2 последовательности. Если просто вбить этот паттерн, то по всем белкам находится 700 последовательностей.