Онтологии.

Описание функции белка OBG_BACSU в соответствии с GO-аннотацией

	Онтология GO (название словаря)	Количество разных ассоциированных терминов GO	Функция белка (краткое описание, близкое к тексту определения термина(ов) GO
Где?	Component	2	Цитоплазма
Зачем, для чего?	Process	2	Катаболизм ГТФ, споруляция и формирование клеточной споры
Молекулярный механизм?	Function	1	ГТФазная активность
Специфичность?	Function	9	связывание ГТФ, ионов магния

Описание терминов GO

GO ID выбранного термина	Список синонимов	Список ближайших родительских терминов GO с указанием типа связи	Список ближайших дочерних терминов GO с указанием типа связи
GO:0030435	cellular spore formation by sporulation spore biosynthesis spore differentiation spore formation	part_of biological_process part_of developmental process part_of anatomical structure development is_a cellular process part_of anatomical structure morphogenesis is_a cellular developmental process is_a anatomical structure formation involved in morphogenesis is_a cell differentiation is_a sporulation	Part of spore wall biogenesis; Is a sexual sporulation resulting in formation of a cellular spore; Is a asexual sporulation resulting in formation of a cellular spore; Positively regulates positive regulation of sporulation resulting in formation of a cellular spore; Regulates regulation of sporulation resulting in formation of a cellular spore; Negatively regulates negative regulation of sporulation resulting in formation of a cellular spore.
GO:0003924	-	is_a molecular_function is_a catalytic activity is_a hydrolase activity is_a hydrolase activity, acting on acid anhydrides is_a hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides is_a pyrophosphatase activity is_a nucleoside-triphosphatase activity	GTP-dependent helicase activity is_a GTPase activity
GO:0005737	-	part_of cellular_component part_of cell part_of cell part part_of intracellular is_a intracellular part	cytoplasmic part part_of pole plasm is_a sarcoplasm is_a

Протеом бледной трепонемы (Treponema pallidum (strain Nichols)).

• число белков протеома = 1029;
• поиск с помощью SRS по UniProtKB = 1033;
• метод расширенного поиска = 747. Белков без описания функции:
• всем белкам приписана хотя бы одна функция
• Распределение количества записей в зависимости от записанной информации
  
• Словарь локализация:

   GO:0005737	131	цитоплазма
   GO:0016021	126	встроенный в мембрану
   GO:0005886	119    плазматическая мембрана
   

  Словарь функция:

   GO:0005524   145    связывание АТФ
   GO:0046872	62     связывание ионов металла
   GO:0003735   52     структурная составляющая рибосомы
   GO:0003677	46	связывание ДНК
   

  Словарь процесс:

   GO:0006412	58	трансляция
   GO:0006508   25     протеолиз
   GO:0001539   23     подвижность ресничек или жгутика
   GO:0051301	19	деление клетки
   GO:0006281	18	репарация ДНК
   GO:0007049	18	клеточный цикл
   

• Все изученные белки несут какую либо важную функцию. Распространенность соответсвующих функций согласуется с их значимостью в клетке. Так же интересно что, белков участвующих в движении жгутика трепонемы, больше чем белков репарации или деления.

Выборка последовательностей белков с заданной функцией.

• Корова - самка домашнего быка, парнокопытного жвачного животного семейства полорогих (Bovidae). Разводится для получения мяса, молока и кожи.
• Rank: species. Вид. Bos taurus = Bos bovis, cow = bovine = domestic cattle = domestic cow.
• Taxonomy ID: 9913
• GO:0006412 translation - трансляция. Тип словаря: процесс.
• Параметры поиска

       NCBI_Tax ID: 9913
       DBname:GO
       DBxref:GO:0006412
       

  Результат:375 находок. Файл с последовательностями.