Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~colin_kondr/term2/meme.html
Дата изменения: Mon May 9 00:44:15 2011
Дата индексирования: Tue Oct 2 11:19:06 2012
Кодировка: Windows-1251
MEME & MAST.

MEME & MAST.

    Поиск мотивов программой MEME

  1. Найдено 3 мотива.
  2. Все мотивы найдены во всех белках OBG. Ни один не найден в ERA_CALS8.
  3. Координаты и P-value в последовательности OBG_BACSU. 
     
      Motif1 125-175 2.49e-47 
      Motif2 206-246 2.72e-43
      Motif3 15-65   1.49e-49
  4. Длина и E-value. 
          Motif1 50 3.2e-054
      Motif2 40 1.2e-048
      Motif3 50 3.3e-055

    MEME & Muscle

    Motif1.

    Motif2.

    Motif3.


    С выравниванием Muscle не совпадает Motif2. Возможно это связано с тем, что MeMe делает частичное выравнивание.

    Поиск найденных мотивов в других последовательностях

    mastout
    Только третий мотив был найден в 8 белках.
    Ни в одном белке не нашлись все мотивы.
    Мотивы соответствуют выравниванию Pfam.

    © Nikolay Kondratev