Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~artemov/term3/sem3credit1.html
Дата изменения: Sat Oct 13 01:20:27 2007
Дата индексирования: Tue Oct 2 12:48:25 2012
Кодировка: Windows-1251
Семестр 3: Блок 1: Зачет 1: Аннотация генов

// Семестр 3: Блок 1: Последовательности нуклеиновых кислот

 // EMBL // BLAST // гомологи некодирующей нуклеотидной последовательности 

// аннотация генов

Был произведен поиск в базе данных протеома Escherichia coli K-12 гомологов последовательнотельностей, полученных автоматической трансляцией открытых рамок считывания из фрагмента генома Yersinia intermedia. Так как поиск осуществлялся по белковой последовательности в базе белковых последовательностей, была использована программа blastp.

Гипотетические гены на участке 1..7000 последовательности AALF01000002:
3'--[<=ген zwx, 71-1642]---------------------------------------------5'

5'--------------------------[=>ген hexR, 1869-2771]------------------3'


3'-------------------------------------[<=ген msbB, 4674-5717]-------5'

5'----------[=>ген pykA, 3150-4589]----------------------------------3'


3'--[<=ген yebA, 5819-6979]------------------------------------------5'

5'-------------------------------------------------------------------3'

Сравнение взаимного расположения предсказанных генов в исследуемом фрагменте и сходных аннотированных генов E. coli.

Расположение генов в геноме двух бактерий идентично, см. книгу Excel