1. Prosite - первая, в своем роде, база данных, в которой содержатся биологически значимые сайты, паттерны и профили, т.е. те участки аминокислотных последовательностей белков, которые могут нести какую-либо биологическую функцию.Документ Prosite может быть представлен либо в виде паттерна - для сайтов - или профиля PSSM (для мотивов, выводимых из большего числа последовательностей)
2. Pfam - база данных, в которой содержится большая коллекция множественных выравниваний, доменов, семейств и профилей-HMM для них. Она удобна для анализа доменной структуры белков.


3. InterPro - эта база данных, появившаяся в 1999 году представляет собой интегрированый ресурс белковых семейств, доменов и функциональных сайтов. Она содержит все документы таких баз данных как: Prosite, Pfam, ProDom и всех подобных им.

Главная страница             

Второй семестр