Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~alexa-sh/term3/text/analysis.html
Дата изменения: Tue Oct 5 23:14:10 2010
Дата индексирования: Tue Oct 2 18:36:02 2012
Кодировка: Windows-1251
A- и В- формы ДНК. Структура РНК

A- и В- формы ДНК. Структура РНК

Ссылка на Google

Ссылка на сайт kodomo

Задание 2


ДНК в проволочной модели

РНК в проволочной модели

Задание 3

Упражнение 1

1. В сторону большой бороздки обращены атомы с32.n4
2. В сторону малой бороздки обращены атомы c32.o2
3. Остальные атомы основания c32.n1,c32.c2,c32.n3,c32.c4,c32.c5,c32.c6

Упражнение 2
 A-формаB-форма*Z-форма
Тип спирали (правая или левая) правая правая левая
Шаг спирали (Å) 28,0133,7544,2
Число оснований на виток 121112
Ширина большой бороздки 16,8117,217,20
Ширина малой бороздки 7,9811,697,20

Упражнение 3
Сравнение торсионных углов в А- и B- формах
Углы α β γ δ ε ξ χ
А-форма
Презентация		 -62 173 52 88 или 3 178 -50 -160
А-форма
RasMol		 -51.69 174.79 41.68 79.09 -147.84 -75.06 -157.18
B-форма
Презентация		 -63 171 54 123 или 131 155 -90 -117
B-форма
RasMol		 -29.87 136.32 31.14 143.35 -140.76 -160.49 -97.95

Задание 4

Упражнение 1
  1. углы почти не отличаются
  2. Структура тРНК больше похожа на структуру А-формы
  3. Углы α β γ δ ε ξ χ
    B-форма
    RasMol    		 -29.87 136.32 31.14 143.35 -140.76 -160.49 -97.95
    Углы самого кривого нуклеотида 10A strand I 98.7 -123.3 171.3 134.4 -169.9 -84.9 -130.7
Упражнение 2
  1. Акцепторный стебель - 5' 2-7 3' и 5' 66-71 3'
    D-стебель - 5' 10-12 3' и 5' 23-25 3'
    T-стебель - 5' 49-53 3' и 5' 61-65 3'
    Антикодоновый стебель - 5' 26-33 3' и 5' 37-41 3'
  2. U-*---A, A-*---U, A-*---U, G-**+-C - канонические пары, но неканоническое взаимодействие
    U-**+-G, U-*---U, C-*---A, A-**+-A, U-**+-U - неканонические пары
  3. Есть дополнительные водородные связи в тРНК, стабилизирующие ее третичную структуру - 19G-C56, 46U-U47, 54U-A58, 55U-G18, 14A-U8, 15G-C48
Упражнение 3
Стекинг-взаимодействие

© Шерстюк Александра, MSU 2009