Банки данных Swiss-Prot и UniProt

• Данные банка Swiss-Prot о белке TAUD_ECOLI

  Содержание поля	Метка поля	Запись
  Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа	AC	P37610; P77797; Q47540;
  Стандартное имя последовательности	ID	TAUD_ECOLI STANDARD; PRT; 282 AA.
  Название белка, отражающее его функции	DE	Альфа-Кетоглутарат-Зависимая Таурин Диоксигеназа; 2-аминоэтансульфонат диоксигеназа; (Sulfate starvation-induced protein)
  Дата создания документа	DT	1 октября 1994 г. (30-й выпуск)
  Дата последнего исправления аннотации	DT	01 февраля 2005 (46-й выпуск)
  Название организма	OS	Escherichia coli
  Полное название таксона	OC	Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia.
  Длина последовательности	SQ	282 аминокислотных остатка
  Молекулярная масса белка	SQ	32278 г./моль
  Число публикаций, использованных при создании документа	RN	8
  Название журнала с самой свежей публикацией	RL	Biochemistry (2002 г.)
  Описание вторичной структуры	FT	Последовательность а-спиралей поворотов и в-тяжей в белке
  Коментарии (содержание)	CC	Функция, катализируемая реакция, кофактор. Регуляция активности, оптимум pH, участие в биологических процессах, вид биологической субъединицы, принадлежность семейству, предостережения
  Особенности последовательности	FT	Содержит сайты связывания железа в позициях 98, 100, 254; посттрансляционные замены аминокислот 127, 239, 247
  Идентификатор файла PDB	DR	1gy9; 1gqw; 1os7

  данные получены из: банка данных Swiss-Prot (original format)

• В БД UniProt с помощью поисковой системы SRS производился поиск белков с тем же кратким описанием (DE), что и у белка TAUD_ECOLI

  Результаты поиска:

  Таксон	Запрос	Количество найденных документов
  Археи ( Archaea)		0
  Бактерии (Bacteria)	Query "((((([uniprot-Description:Alpha-ketoglutarate-dependent*] & [uniprot-Description:taurine*]) & [uniprot-Description:dioxygenase*]) | [uniprot-Description:Alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase*]) | (([uniprot-Description:aminoethanesulfonate*] & [uniprot-Description:dioxygenase*]) | [uniprot-Description:aminoethanesulfonate dioxygenase*])) | ((([uniprot-Description:Sulfate*] & [uniprot-Description:starvation-induced*]) & [uniprot-Description:protein*]) | [uniprot-Description:Sulfate starvation-induced protein*]))	15 (прим. по данному запросу все документы в поле Taxonomy содержали слово Bacteria)
  Эукариоты (Eukaryota)		0