База данных промоутеров эукариот.

Общие сведения.

• Исследуемая база данных - Eukaryotic Promotor Database.
• Авторами данной базы данных, созданной сначала в научном институте Вайцмана города Реховот (Израиль) и в настоящее время поддерживаемой ISREC в Epalinges s/Lausanne (Швейцария) являются Philipp Bucher, Rouaida Cavin Perier, Viviane Praz и Christoph Schmid.
• Последнее обновление производилось 13.04.2006 (release 86). Всего насчитывается 4809 записей, накопленные за 20 лет - такое сравнительно небольшое количество объясняется тем, что данные были получены экспериментально.

Пользовательские свойства стартовой страницы.

На стартовой странице есть поле быстрого поиска по АС, ID из данного БД.Рядом доступ к другим возможностям данного банка:

• Поиск промоутеров эукариот
• Загрузка последовательностей промоутеров
• Сопоставление последовательностей BLAST и EPD(поиск промоутеров по аминокислотной последовательности)
• Промоутерные элементы
• Доступ к ftp-серверу: либо локально, либо через NCBI
• Доступ к EPD через SRS

• Представлены ссылки на публикации по EPD, где можно почерпнуть дополнительную информацию - это статьи из PUBMED
• База данных поддерживается Национальным Научным Фондом Swiss, web-интерфейс был поддержан грантом EC за сотрудничество с TRADAT
• Внизу странички есть ссылки на другие базы данных сервера SIB-Lausanne

Описание поиска на данном сервисе.

Для того, чтобы произвести поиск в данном банке данных необходимо
пойти по ссылке: "Browse the Eukaryotic Promoter Database".
Поисковый аппарат сходен по интерфейсу с SRS. Из возможных вариантов
мы выбрали поиск по AC Swiss-prot. Но по причине того, что данный
банк данных намного меньше Swiss-prot'a, мы выбрали AC, для промоутера
которого существует запись в этой базе данных.

При поиске был получен следующий результат:

Мы решили воспользоваться другим сервисом:"BLAST sequences
against the EPD database", т.е. запустить Бласт по этой
базе данных. (Данная ссылка находится на главной странице)
Была взята часть последовательности из записи, упомянутой 
выше.