Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~zloygenii13/UniProt2.doc Дата изменения: Tue Feb 12 20:05:14 2008 Дата индексирования: Tue Oct 2 03:25:26 2012 Кодировка: koi8-r

| |Метка поля|Содержание |
|Код(ы) доступа |AC |P00448; Q2M8K5; |
|Идентификатор записи|ID |SODM_ECOLI |
|в БД | | |
|Название (краткое |DE |Superoxide dismutase [Mn] (EC 1.15.1.1) |
|описание) белка | |(MnSOD). |
|Дата создания |DT |21-JUL-1986, integrated into |
|документа | |UniProtKB/Swiss-Prot. |
|Дата последнего |DT |20-FEB-2007, entry version 86. |
|исправления |(Но | |
|аннотации |смотрим | |
| |последнюю | |
| |запись) | |
|Число публикаций, |RN |15 |
|использованных при | | |
|создании документа | | |
|Журнал и год самой |RL |J. Mol. Biol. 296:951-959(2000). |
|поздней публикации | | |
|Ключевые слова |KW |3D-structure; |
| | |Complete proteome; |
| | |Direct protein sequencing; |
| | |Manganese; |
| | |Metal-binding; |
| | |Oxidoreductase. |
|Что содержит поле |CC |FUNCTION , CATALYTIC ACTIVITY , |
|комментариев? | |COFACTOR , SUBUNIT , SIMILARITY |
|Идентификаторы |DR |1D5N; X-ray; A/B/C/D=1-206. |
|записей PDB | |1I08; X-ray; A/B/C/D=1-206. |
| | |1I0H; X-ray; A/B=1-206. |
| | |1IX9; X-ray; A/B=1-206. |
| | |1IXB; X-ray; A/B=1-206. |
| | |1MMM; X-ray; A/B=1-206. |
| | |1VEW; X-ray; A/B/C/D=1-206. |
| | |1ZLZ; X-ray; A/B=1-206. |


Работа с поисковой системой UniProt
Данные о белке SODM_ECOLI по данным UniProt




Сравнение зависимости количества найденных данных от формулировки запроса в
UniProt и TrEMBL
|Запрос |UniProt |TrEMBL |
|SODM_ECOLI |1 |7 |
|SODM |177 |27 |
|Superoxide |134 |19 |
|dismutase | | |
|[Mn] | | |

Дополнительная информация о сравнении SODM_ECOLI и SODM_HUMAN

| |Метки |SODM_ECOLI |SODM_HUMAN |
| |поля | | |
| |AC |P00448 |P04179 |
|Первый код доступа| | | |
| |ID |SODM_ECOLI |SODM_HUMAN |
|Идентификатор | | | |
|последовательности| | | |
|в БД | | | |
| |DE |Superoxide dismutase|Superoxide dismutase|
|Название (краткое | |[Mn] |[Mn], mitochondrial |
|описание) белка | | |[Precursor] |
| |DT |July 21, 1986 |March 20, 1987 |
|Дата создания | | | |
|документа | | | |
|Дата последнего |DT |February 5, 2008 |February 5, 2008 |
|исправления |(смотрим |(Entry version 95) |(Entry version 112) |
|аннотации |последнюю| | |
| |запись) | | |
|Название организма|OS |Escherichia coli |Homo sapiens |
| | |(strain K12) | |
| |OC |Bacteria; |Eukaryota; Metazoa; |
|Классификация | |Proteobacteria; |Chordata; Craniata; |
|организма (список | |Gammaproteobacteria;|Vertebrata; |
|таксонов) | |Enterobacteriales; |uteleostomi; |
| | |Enterobacteriaceae; |Mammalia; Eutheria; |
| | |Escherichia |Euarchontoglires; |
| | | |Primates; |
| | | |Haplorrhini; |
| | | |Catarrhini; |
| | | |Hominidae; Homo |
|Длина |SQ(1 |206 AA |222 AA |
|последовательности|запись) | | |
| | | | |
|Молекулярная масса|SQ(2 |23097 MW |24722 Da |
|белка |запись) | | |
| | RN |15 |21 |
|Число публикаций, | | | |
|использованных при| | | |
|создании документа| | | |
|Журнал и год самой|RL |J. Mol. Biol. |Biochemistry |
|поздней публикации| |296:951-959(2000). |40:12051-12058(2001)|
| | | |. |
| | |4 иона Магния, 1 |5 ионов Магния, 6 |
|Описание вторичной| |остаток может быть |остатков могут быть |
|структуры | |замещен, 1 остаток о|замещены и 8 |
|Укажите, есть ли | |происхождении |остатков неизвестны |
|такое описание, и | |которого |или точно не |
|в чем оно состоит.| |сомневаются. |установлены. |
|Ключевые слова |KW |3D-structure; |3D-structure; |
| | |Complete proteome; |Acetylation; |
| | |Direct protein seque|Direct protein seque|
| | |ncing; Manganese; |ncing; Manganese; |
| | |Metal-binding; |Metal-binding; |
| | |Oxidoreductase. |Mitochondrion; |
| | | |Oxidoreductase; |
| | | |Polymorphism; |
| | | |Transit peptide. |
| | | | |
|Темы, освещённые в| | | |
|комментариях | | | |
|Особенности | |Возможна замена 1 |Возможна замена 6 |
|последовательности| |аминокислоты и 1 |аминокислотных |
| | |конфликтное место. |остатков, 8 |
|Не копируйте, а | | |конфликтных мест. |
|перечислите, какие| | | |
|особенности | | | |
|отражены в | | | |
|документе! | | | |
|Идентификаторы |DR |1D5N; 1EN4; 1EN5; |1AP5; 1AP6; 1EM1; |
|записей PDB | |1EN6; 1I08; 1I0H; |1JA8; |
| | |1IX9; |1LUV; 1LUW; 1MSD; |
| | |1IXB; 1MMM; 1VEW; |1N0J; 1N0N; 1PL4; |
| | |1ZLZ; |1PM9; |
| | | |1QNM; 1SZX; 1VAR; |
| | | |1XDC; 1XIL; 1ZSP; |
| | | |1ZTE; |
| | | |1ZUQ; 2ADP; 2ADQ; |
| | | |2GDS; 2P4K; |
| | |