Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~zini/term2.html
Дата изменения: Tue Jun 8 14:48:18 2004
Дата индексирования: Mon Oct 1 21:41:54 2012
Кодировка: Windows-1251
Второй семестр

Второй семестр

Программы, с которыми мы работали:

  1. FAR manager
  2. Internet Explorer
  3. Microsoft Word
  4. Microsoft Excel
  5. GeneDoc
  6. Пакет программ EMBOSS:
    • needle - программа попарного глобального выравнивания
    • water - программа попарного локального выравнивания
    • matcher - программа попарного локального выравнивания
    • emma - программа множественного выравнивания


Во втором семестре мы получили представление о важнейших методах исследования аминокислотных последовательностей, познакомились со структурой биоинформатических банков данных и научились работать с ними. Практические навыки, полученные во втором семестре не позволят растеряться в ситуации недостатка информации о последовательности.


Кроме того, важным было ознакомление с алгоритмами, лежащими в основе работы программ попарного и множественного выравниваний, поиска по Blast и Psi-Blast, а также с матрицами аминокислотных замен. Одним словом, второй семестр принес массу фундаментальных знаний и навыков.


Результаты работы за второй семестр


  1. Поиск в банках аминокислотных последовательностей белков с теми же функциями,
    что и у белка TolB protein precursor E.coli
  2. Алгоритмы попарного выравнивания
  3. BLASTP - поиск последовательностей по гомологии
  4. Описание общей доменной структуры белка TolB protein precursor E.coli и известных мотивов в его аминокислотной последовательности
  5. Деревья



Переход на главную страничку здесь.