Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~yaros/term2/BlockIII/InterPro.html
Дата изменения: Tue May 30 19:49:24 2006
Дата индексирования: Tue Oct 2 18:45:29 2012
Кодировка: Windows-1251
InterPro

База данных InterPro

Второй семестр

   Описание документа InterPro

   Нашей целью было определить запись InterPro c наибольшим числом подписей, эта запись: IPR001986. Полное название документа EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase) или 3-фосфошикимат 1-карбоксивинилтрансфераза. В поле подписей суммарно было 3086 белков.

   Опиcание всех подписей в белке AROA_ECOLI, собранные в БД InterPro.

   Изображение всех мотивов в последовательности (кроме структурных)



  Данная подпись моего белка в InterPro (IPR001986) находится в отношении вложенности к подписи IPR005750 в отношении родства к моей подписи есть подпись IPR006264.   Таблица: описание подписей в белке AROA_ECOLI.
Название подписи Положение в последовательности Aroa_Ecoli Полное название базы данных
EPSP_synth 9-420 ProDom
EPSP_synthase 6-420 Pfam
EPSP_SYNTHASE_1 90-104 Prosite
EPSP_SYNTHASE_2 338-256 Prosite
aroA 14-426 TIGRFAMs


©Ярослав, Карпович