Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~wave/files/Credit3/Practice13.doc Дата изменения: Fri Dec 17 00:45:50 2004 Дата индексирования: Tue Oct 2 18:28:14 2012 Кодировка: koi8-r

Сравнение методов реконструкции деревьев

|Ветвь |Исходное дерево |Neighbor- |Максимальное |
| | |Joining |правдоподобие |
|ABCDEF | | | |
|000011 |+ |+ |+ |
|011000 |+ |+ |+ |
|011100 |+ |+ |+ |



Neighbor-joining method


+-----------E.EMBL
+--3
! +-------------F.EMBL
!
--4----------------------------------A.EMBL
!
! +------------B.EMBL
! +--1
+----2 +------------C.EMBL
!
+----------------D.EMBL



Максимальное правдоподобие

+------C.EMBL
!
! +-----------------------------A.EMBL
! +--4
! ! ! +-------F.EMBL
--1--2 +--3
! ! +------E.EMBL
! !
! +--------D.EMBL
!
+------B.EMBL


Соответствие внутренних веток показывает, что реконструкция хода
эволюции при такого уровня расстояниях между последовательностями
достаточно надёжна.
-----------------------
10

EF

BC

BCD

BCDEF

ABCDEF

90

25

25

35

5

30

30

10

50

F

E

D

C[pic]

B

A