Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~vlada/term4/function_ret.html
Дата изменения: Tue Apr 24 22:45:22 2007 Дата индексирования: Tue Oct 2 12:15:30 2012 Кодировка: Windows-1251 |
На главную страницу четвертого семестра
Дополнительные упражнения
Но этом фрагменте изображено отношение "ligase activity is catalytic activity" |
Но этом фрагменте изображено отношение "cell part is part of cell". Данное отношение можно трактовать так: часть (органелла) клетки не способна в природе существовать вне клетки, хотя встречаются клетки без некоторых частей. |
Данный вид связи на графе встречается часто. |
Онтология GO (имя) | Количество ассоциированных терминов GO | Краткий ответ на вопрос | Данные EcoCyc | |
---|---|---|---|---|
Где? | Клеточные компоненты (Component) | 0 | - | цитоплазма |
Зачем, для чего? | Биологический процесс (Process) | 4 | биосинтез аргинина, биосинтез аминокислот. | биосинтез аргинина. |
Молекулярный механизм? | Молекулярные функции (Function) | 9 | нуклеотидное связывание, активность при синтезе аргининосукцината (катализирует следующую реакцию: ATP + L-citrulline + L-aspartate = AMP + diphosphate + (Nw-L-arginino)succinate, лигазная активность, связывание АТФ, связывание белка. | L-aspartate + citrulline + ATP <=> L-arginino-succinate + diphosphate + AMP. Реакция является обратимой. |
Специфичность? | Молекулярные функции (Function) | 3 одинаковых записи (из след. источников: UniProt, InterPro, HAMAP) | Специфичность данного белка описывается в поле Function, но указана она только в трех записях. В них указана соответствующая реакция, где ASSY_Ecoli специфично связывается с L-citrulline. | Кофактором является Mg2+. |
Страничка, которая была выдана EcoCyc, содержит много полезной информации. Запись о белке представлена очень коротко, но можно узнать более подробную информацию, если пойти по ссылкам. На данной страничке имеется информация о гене, о длине последовательности, о молекулярной массе белка. Имеется ссылка на последовательность белка. Имеются ссылки на GO: GO:0006526 - arginine biosynthesis , GO:0005737 - cytoplasm Также имеется ссылки на PDB, Pfam, UniProt. Другая информация представлена в таблице.