Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~vanilin/alg3.txt Дата изменения: Fri May 19 18:56:25 2006 Дата индексирования: Mon Oct 1 22:27:01 2012 Кодировка:

########################################
# Program: needle
# Rundate: Fri May 19 2006 18:53:23
# Align_format: srspair
# Report_file: stdout
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: PPNK_METJA
# 2: PPNK_ECOLI
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 266
# Identity: 80/266 (30.1%)
# Similarity: 143/266 (53.8%)
# Gaps: 8/266 ( 3.0%)
# Score: 343.5
#
#
#=======================================

PPNK_METJA 1 KFGIVVREDKEEAINLAIEICKYLKDKNIPFCVEDFLRERV------GGD 44
..|||.......|:.....:.::|..|.....||..:...: .|.
PPNK_ECOLI 1 CIGIVGHPRHPTALTTHEMLYRWLCTKGYEVIVEQQIAHELQLKNVKTGT 50

PPNK_METJA 45 KFDISAISHI-IAIGGDGTILRASRLVNGETIPIIAVNMGKVGFLAEFCK 93
..:|..::.: :.:||||.:|.|:|.:....|.:|.:|.|.:|||.:...
PPNK_ECOLI 51 LAEIGQLADLAVVVGGDGNMLGAARTLARYDIKVIGINRGNLGFLTDLDP 100

PPNK_METJA 94 DEVFEIIDKVIYGEYEIEKRSKLSCKIIKDNRVIKTPSALNEMVVITKNP 143
|...:.:..|:.|.|..|||..|..::.:.:...:..:|:||:|:.....
PPNK_ECOLI 101 DNAQQQLADVLEGHYISEKRFLLEAQVCQQDCQKRISTAINEVVLHPGKV 150

PPNK_METJA 144 AKILEFDVYVNDTLVENVRADGIIVSTPTGSTAYSLSAGGPIVEPNVDCF 193
|.::||:||:::....:.|:||:|:|||||||||||||||||:.|::|..
PPNK_ECOLI 151 AHMIEFEVYIDEIFAFSQRSDGLIISTPTGSTAYSLSAGGPILTPSLDAI 200

PPNK_METJA 194 IISPICPFKLSSRPLVISASNRIKLKLKLEKPAL-LVIDGSVEYEINKDD 242
.:.|:.|..||:|||||::|:.|:|:....:..| :..|..:...|.:.:
PPNK_ECOLI 201 TLVPMFPHTLSARPLVINSSSTIRLRFSHRRNDLEISCDSQIALPIQEGE 250

PPNK_METJA 243 ELIFEKSDSYAYFVKG 258
:::..:.|.:...:..
PPNK_ECOLI 251 DVLIRRCDYHLNLIHP 266


#---------------------------------------
#---------------------------------------