Учебный сайт
Ромащенко Валерии

	Метка поля	Белок 1	Белок 2
Первый код доступа	AC	P76344	B5CKH0
Идентификатор последовательности в БД	ID	YODA_ECOLI	B5CKH0_SALET
Название (краткое описание) белка	DE	Metal-binding protein yodA, Cadmium-induced protein yodA, Precursor	Metal-binding protein YodA (Cadmium-induced protein yodA)
Дата создания документа	DT	15-DEC-1998, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot.	14-OCT-2008, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
Дата последнего исправления аннотации	DT	16-DEC-2008, entry version 66.	10-FEB-2009, entry version 3.
Название организма	OS	Escherichia coli (strain K12)	Salmonella enterica
Классификация организма (список таксонов)	OC	Bacteria Proteobacteria Gammaproteobacteria Enterobacteriales Enterobacteriaceae Escherichia.	Bacteria Proteobacteria Gammaproteobacteria Enterobacteriales Enterobacteriaceae Salmonella
Длина последовательности	SQ	216 АК	216 АК
Молекулярная масса белка	SQ	24762	24695
Число публикаций, использованных при создании документа	RN	5	2
Журнал и год самой поздней публикации	RL	J. Biol. Chem. 278:43728-43735(2003)	Submitted (JUL-2007) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
Описание вторичной структуры	FT	В описании белка YODA_ECOLI дана информация о особенностях его вторичной структуры. Там омечено наличие в структуре 3 атомов никеля, даны координаты начала и конца одного бета-поворота, восьми альфа-спиралей(helix) и девяти стрендов(strand).	В описании белка B5CKH0_SALET информация о вторичной структуре отстуствует.
Ключевые слова	KW	3D-structure, Complete proteome, Direct protein sequencing, Metal-binding, Nickel, Signal.	Ключевые слова отстуствуют.
Темы, освещенные в комментариях	CC	Может быть задействован в стрессовой реакции. Белок индуцируется ионами кадмия Cd2+. Вещество принадлежит надсемейству белков-калицинов (calycin), семейству YodA.	Представленная здесь последовательность получена из записей в БД EMBL/GenBank/DDBJ и является непроверенной экспериментально.
Особенности последовательности	FT	Белок состоит из одной цепи и 216 АК, связывается с ионами металлов, в частности, с тремя ионами никеля.	Не указаны.
Идентификаторы записей PDB	DR	1OEE, 1OEJ, 1OEK, 1S7D, 1TXL	Не указаны.

Дополнительное задание.

Для поиска белков, похожих на мой и имеющих описание третьичной структуры, я воспользовалась кратким описанием "Metal-binding protein yodA", далее я расширила поиск, добавивь параметр "3D", и отсеяла только те результаты, которые имели информацию о структуре. Таковых оказалось только три, считая и мой белок. Все они находятся в банке данных Swiss-Prot.