Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~v.romashchenko/Term_1/bact.html
Дата изменения: Fri May 22 00:41:28 2009
Дата индексирования: Tue Oct 2 13:24:35 2012
Кодировка: Windows-1251
Romashchenko Valeriya

Учебный сайт
 Ромащенко Валерии


Бактерия Leivsonia xyli
Таксономическая принадлежность

Царство Bacteria
Класс Actinobacteria
Подкласс Actinobacteridae
Отряд Actinomycetales
Подотряд Micrococcineae
Семейство Microbacteriaceae
Род Leifsonia
Вид Xyli

Описание бактерии

Вводная информация.
Leifsonia xyli, бактерия, паразитирующая в проводящих тканях растения, содержит два подвида:
L. xyli subsp. xyli (Lxx) и L. xyli subsp. cynodontis (Lxc). Lxx агент-возбудитель остановки роста корневых отпрысков у сахарного тростника, который имеет промышленное значение. Lxc поражает ксилему некоторых злаковых. В обоих случаях болезнь протекает без явных симптомов. Полная последовательность генома Lxx и ее подробное изучение даст ученым возможность узнать больше о ее биологии и болезнетворности.
Это возможно осуществить через изучение элементов инсерционных (ИЭ) последовательностей (IS-elements) .
С тех пор как ИЭ очень много сообщали о разнообразии бактериального генома, ничего не было известно об их роли в строении
хромосом L. Xyli, но сравнительный анализ ИЭ Lxc и Lxx помог в этом разобраться.

Полученные данные
Образец последовательности генома Lxc и его сравнительный анализ с последовательностью ДНК показал переменную мобильных ИЭ, влияющих на отличия в геномах. Каждый геном показывает уникальный набор элементов несмотря на родство с одинаковым семейством ИЭ, когда рассматриваются такие наследственные признаки, как идентичность среди транспозонов , прямые и обратные последовательности нуклеотидов и размер самого элемента. Большинство Lcx и Lxx семейств ИЭ напрвлены на поддержание транспозиции на низких уровнях, используя трансляционные регуляторные механизмы, согласующиеся с in silico (компьютерное моделирование биологического эксперимента) анализе. Некоторые из IS элементов найдены связанными c перестановкой специфичных областей каждого из геномов. Также различия были найдены во влиянии IS элементов на вставки , хотя ни один элемент не направлен на разрушение генов. Исследование транспозонов между геномами Актинобактерий показывает, что нет никакой взаимосвязи между филогенетическим родством и распределением IS семейств. Используя метод Cаузерн-гибридизации (блоттинга), можно предположить, что разнообразие Lxc ограничивают инсерционные последовательности.
Заключение
Все исследования указывают на то, что мобильные ИЭ влияют на разнообразие генома Lxc и Lxx. ИЭ возможно были приобретены после расхождения двух подвидов, и они связаны со структурой генома и разнообразием генов.
Эти данные окажут влияние на последующие сравнительные исследования биологических различий Lxc и Lxx.

Информация о протеоме.

Хромосома или плазмида Число пар нуклеотидов Число генов Суммарная длина генов (%) Суммарная длина межгенных промежутков (%) GC состав (%)
кольцевая 2584158 2027 3,45% 70% 67.7%
Скачать фаил
На главную

© Ромащенко 2008