Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/FBB/StudentScience/themes_2006/Vrzhesch.doc Дата изменения: Fri Jan 20 10:29:16 2006 Дата индексирования: Sat Dec 22 07:09:04 2007 Кодировка: koi8-r

Тема курсовой или дипломной работы (что очень приветствуется) для студентов
2,3,4 курсов ФББ


ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЕ И ТЕОРЕТИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ЦИКЛООКСИГЕНАЗНОЙ И ПЕРОКСИДАЗНОЙ АКТИВНОСТЕЙ ПРОСТАГЛАНДИН-H-СИНТАЗЫ




Выполнение настоящей курсовой работы предусматривает экспериментальное
исследование циклооксигеназной и пероксидазной реакций, катализируемых
простагландин-H синтазой с использованием в качестве субстратов
арахидоновой кислоты, перекиси водорода и различных доноров электрона.
Предполагается освоение полярографической и спектрофотометрической методик,
освоение методов расчета кинетических кривых, создание и аналитический
расчет кинетических моделей. Данная тема представляет собой самостоятельный
участок работы в научно-исследовательской группе и может выполняться
студентом автономно в удобное время.

Фермент простагландин H-синтаза (PGHS, К.Ф.1.14.99.1) осуществляет
первый этап в биосинтезе всех простагландинов, а также тромбоксанов и
простациклина, катализируя превращение молекулы арахидоновой кислоты в
простагландин Н2. Простагландины - модуляторы сердечно-сосудистой,
желудочно-кишечной и репродуктивной систем, являются медиаторами боли,
воспаления, повышения температуры, аллергии, и поэтому фермент,
катализирующий их биосинтез, представляет собой исключительно важную
фармакологическую мишень. Терапевтический эффект аспирина и других
нестероидных противовоспалительных средств обусловлен ингибированием PGHS.
PGHS является бифункциональным ферментом и катализирует 2 реакции -
циклооксигеназное окисление арахидоновой кислоты двумя молекулами
кислорода с образованием простагландина G2 и пероксидазное восстановление
перекисной группы простагландина G2 в присутствии донора электронов с
образованием простагландина H2. Обе реакции идут на одной молекуле белка
на двух близко расположенных активных центрах. Обе реакции гемзависимы и
сопровождаются необратимой инактивацией фермента в процессе реакции.

В рамках данной работы также планируется:
1. Экспериментальное исследование кинетических свойств фермента
простагландин-H синтазы полярографическим и спектрофотометрическим
методами.
2. Изучение характеристик белка PGHS (биологическая роль, изоформы,
особенности структуры, катализируемые реакции)
3. Изучение механизма взаимодействия циклооксигеназного и пероксидазного
активных центров фермента PGHS (на основании литературных данных и
расчетов методами молекулярной динамики).
4. Анализ строения активных центров фермента и выяснение роли ближайшего
амнокислотного окружения активных центров. (Анализ трехмерных структур
изоферментов простагландин H синтазы и оценка влияния точечных
аминокислотных замен на структурные и функциональные особенности
белка.).
5. Расчет взаимодействия основных субстратов (арахидоновой кислоты,
кислорода, простагландина G2 и др.) с активными центрами методами
квантовой химии и молекулярной динамики.

Руководитель работы:
профессор Вржещ Петр Владимирович, факультет биоинженерии и
биоинформатики МГУ, к. 407, тел. 939-4218, mailto: peter@genebee.msu.ru