Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/FBB/year_02/science_1/otzyvy/onFedoseyeva.doc Дата изменения: Thu Nov 13 20:15:27 2003 Дата индексирования: Sat Dec 22 07:26:59 2007 Кодировка: koi8-r

Отзыв на курсовую работу студентки второго курса Факультета
биоинженерии и
биоинформатики Федосеевой С.В. «Поиск растительных белков - возможных
субстратов растительных каспаз».


Молекулярные механизмы апоптотических процессов находятся в центре
научных интересов клеточных биологов. К настоящему времени достигнуто
относительно полное понимание основных закономерностей этого процесса в
животных организмах. Однако только косвенные признаки позволяли
предполагать, что программированная клеточная смерть в растительных
организмах протекает похожим образом. Обнаружение агробактериального белка,
функционирующего в растительной клетке и являющегося субстратом для
человеческой каспазы-3 - основного исполнителя апоптоза в животных клетках,
позволило выделить аналогичную активность из апоптотических растительных
клеток. Это подтвердило сходство в механизмах программированной клеточной
смерти в животном и растительном мирах и стало основой для поиска
растительных белков - естественных мишеней растительной каспазы.
В курсовой работе для создания программы поиска возможных белков-
субстратов использовано два существенных момента: аминокислотная
последовательность площадки узнавания (с учетом возможной вырожденности) и
обнаруженная в животных системах (а также подтвердившаяся в случае
агробактериального белка) закономерность: производимый каспазой разрыв
лишает белок сигнала ядерной локализации, т.е. сайт узнавания надо искать
вблизи или внутри последовательности, направляющей белок в ядро.
Компьютерный поиск в настоящий момент является единственным подходом к
решению проблемы растительных белков - возможных субстратов растительных
каспаз.
Предпринятый в работе поиск, наряду с заведомо случайными белками,
позволил выявить несколько перспективных кандидатов на экспериментальную
проверку.
Таким образом, поставленную в курсовой работе задачу можно считать
полностью выполненной. В ходе ее выполнения С.В.Федосеева, помимо чисто
компьютерной части, ознакомилась с литературой, имеющей отношение к
биохимической стороне апоптотических процессов и достаточно глубоко
разобралась в экспериментальной части проводящейся в Лаборатории работы,
проявив при этом настоящий интерес и увлеченность.
В целом работа может быть оценена как отличная.





Научный руководитель, с.н.с., к.х.н. Чичкова
Н.В.