Материалы к занятию 4

Задания

Перед началом выполнения заданий заведите в директории Term1 поддиректорию Practice2, в ней – файл протокола.

1. Простейшее использование поисковых систем Google, Rambler, Yandex
   Запустите браузер («Mozilla» или «Internet Explorer»). Наберите в адресной строке один из URL поисковых систем:

   1. http://www.google.com/

   2. http://www.rambler.ru/

   3. http://www.yandex.ru/

Затем нажмите <Ctrl+T> и в другой закладке наберите адрес другой системы, еще раз нажмите <Ctrl+T> и наберите адрес третьей. В окошко поиска на всех трех страницах наберите слово «биоинформатика», запустите поиск. Занесите в протокол: сколько всего веб-страниц найдено каждой из систем (это написано перед ссылками на находки); имеется ли на первой странице результата ссылка на сайт нашего факультета; если да, то каким по счету; что представляет собой первая по счету находка.

2. Поиск информации о своей бактерии

Откройте файл «Student_bacteria_07.xls» на диске P и найдите против своей фамилии родовое и видовое название бактерии. Поищите в трех поисковых системах информацию об этой бактерии. Занесите в протокол: сколько всего страниц найдено каждой из систем, что представляет собой первая по счету находка; удалось ли найти информацию о бактерии на русском языке, если да, то какую.

3. Поиск информации о своей бактерии на сайте EBI

   1. Со страницы Google перейдите по ссылке «Расширенный поиск». В окошко «Найти результаты с точной фразой» внесите (через пробел) родовое и видовое название бактерии. В окошко «только с сайта или домена» внесите ebi.ac.uk (домена Европейского института биоинформатики – European Bioinformatics Institute, EBI). Запустите поиск. Обратите внимание, что появилось в окошке запроса; скопируйте запрос в протокол.

   2. В результатах поиска найдите наиболее информативную страницу (скорее всего, она будет первой по счету) и скопируйте с нее текст с информацией о бактерии в файл с подходящим названием. URL найденной страницы скопируйте в протокол.

4. Поиск информации о своей бактерии на сайте NCBI
   Сайт NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) снабжен собственной поисковой системой «Entrez».
   Занесите в протокол, как расшифровывается NCBI.
   Запустите поиск. Скопируйте в протокол URL появившейся страницы. С этой страницы перейдите по гиперссылке «Genome Project» (если трудно найти эту гиперссылку глазами, воспользуйтесь поиском по странице: <Ctrl+F>). На странице геномного проекта найдите текст с описанием бактерии и скопируйте в файл с подходящим названием. Если на странице имеется изображение бактерии, сохраните картинку в свою директорию (щелкните по картинке правой кнопкой мыши и выберите подходящее действие из открывшегося меню; при затруднениях – спрашивайте!). В протоколе опишите, что еще можно найти на этой странице.
   
   

5. Домашнее задание:
   На основании информации, добытой в двух или трех предыдущих упражнениях, составьте краткий текст на русском языке: что это за бактерия, чем она интересна, почему (по вашему мнению) были потрачены усилия на секвенирование ее генома.