Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/FBB/year_04/doc/term2/task_6.html
Дата изменения: Fri Mar 18 14:34:54 2005
Дата индексирования: Sat Dec 22 07:17:04 2007
Кодировка: Windows-1251
Practice 6

Задание 6. Построение схемы переходов глобального выравнивания

Скопируйте в свою рабочую директорию (H:/:./Practice6) файл P:/y04/TERM2/Practice6/matrix.xls.

В Excel-документе matrix.xls на листе "global" постройте схему переходов глобального выравнивания для следующих 2-х последовательностей:
1) Последовательность первых 4-х остатков вашего белка.
2) Последовательность из 5 букв, полученную следующим образом: внесите в последовательность первых 4-х остатков вашего белка две любые замены и в произвольном месте вставьте дополнительную букву.

Выделите оптимальный путь цветом. В протоколе опишите свои наблюдения: вес выравниваний, свойства оптимального пути. Любые дополнительные наблюдения приветствуются. Параметры для построения схемы переходов: вес совпадения = 2, вес замены = –1, штраф за делецию = –2.

См. указания.